RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491952.1

TTC3-222, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 3, human

TSL 5

Gene TTC3, Length 247 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC3-222	ENST00000491952	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	IRF2BPL	Q9H1B7	796 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	MIR1-1HG	Q9H1L0	117 aa		5.86	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	FAM221A	A4D161	298 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	OXR1	Q8N573	874 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	RNF19A	Q9NV58	838 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		5.85	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	LRRN2	O75325	713 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	CILP	O75339	1184 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	5.84	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	RELT	Q969Z4	430 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	NOC4L	Q9BVI4	516 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	JAG2	Q9Y219	1238 aa		5.84	□□□□□ -1.47
TTC3-222	ENST00000491952	SHISA3	A0PJX4	238 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	HRK	O00198	91 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	KRTAP10-2	P60368	255 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	CHRNE	Q04844	493 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	PHC3	Q8NDX5	983 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	KCNH3	Q9ULD8	1083 aa		5.83	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	PSPN	O60542	156 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF605	Q86T29	641 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	NLRX1	Q86UT6	975 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	SPPL2C	Q8IUH8	684 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	ADAMTS20	P59510	1910 aa		5.82	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	TRIM13	O60858	407 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	RLBP1	P12271	317 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	ST13	P50502	369 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	KREMEN1	Q96MU8	473 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	ASPN	Q9BXN1	380 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	KCTD3	Q9Y597	815 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		5.81	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	PLCG1	P19174	1290 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	SSPN	Q14714	243 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	MAP3K11	Q16584	847 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	FAM13C	Q8NE31	585 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	ARID3A	Q99856	593 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	SGPP1	Q9BX95	441 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	MBD1	Q9UIS9	605 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	USP31	Q70CQ4	1352 aa		5.8	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	DNAJA2	O60884	412 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	CTSH	P09668	335 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	BMP7	P18075	431 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	LTK	P29376	864 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	YARS	P54577	528 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	LMNB2	Q03252	620 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	DUSP4	Q13115	394 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	ZNF385B	Q569K4	471 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		5.79	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	CNOT6	Q9ULM6	557 aa	Known RBP	5.79	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	5.79	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	CHURC1-FNTB	B4DL54	471 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	NRDC	O43847	1150 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	LMNB1	P20700	586 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	KCNA1	Q09470	495 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	TCERG1L	Q5VWI1	586 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	CXorf38	Q8TB03	319 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	5.78	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	RHOV	Q96L33	236 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	HDAC8	Q9BY41	377 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		5.78	□□□□□ -1.48
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM82	A0PJX8	343 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	F13A1	P00488	732 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	GALK1	P51570	392 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	CAMK2G	Q13555	558 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	TMEM151B	Q8IW70	566 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	PANK1	Q8TE04	598 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	CCDC74B	Q96LY2	380 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	GPR160	Q9UJ42	338 aa		5.77	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	DAB2	P98082	770 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	RNF111	Q6ZNA4	994 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	SIGLEC10	Q96LC7	697 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	CNTD2	Q9H8S5	307 aa		5.76	□□□□□ -1.49
TTC3-222	ENST00000491952	OR14I1	A6ND48	311 aa		5.75	□□□□□ -1.49

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