RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491607.5

SMIM4-205, Transcript of small integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SMIM4, Length 314 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4-205ENST00000491607 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SMIM4-205ENST00000491607 MAP2K5Q13163 448 aa22.1■■□□□ 1.13
SMIM4-205ENST00000491607 COG2Q14746 738 aa22.1■■□□□ 1.13
SMIM4-205ENST00000491607 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.1■■□□□ 1.13
SMIM4-205ENST00000491607 SH2D4AQ9H788 454 aa22.1■■□□□ 1.13
SMIM4-205ENST00000491607 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.1■■□□□ 1.13
SMIM4-205ENST00000491607 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.09■■□□□ 1.13
SMIM4-205ENST00000491607 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.09■■□□□ 1.13
SMIM4-205ENST00000491607 CCDC17Q96LX7 622 aa22.09■■□□□ 1.13
SMIM4-205ENST00000491607 NBPF3Q9H094 633 aa22.09■■□□□ 1.13
SMIM4-205ENST00000491607 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.09■■□□□ 1.13
SMIM4-205ENST00000491607 SLC15A5A6NIM6 579 aa22.08■■□□□ 1.13
SMIM4-205ENST00000491607 PTPREP23469 700 aa22.08■■□□□ 1.13
SMIM4-205ENST00000491607 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SMIM4-205ENST00000491607 ATP2B2Q01814 1243 aa22.08■■□□□ 1.13
SMIM4-205ENST00000491607 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.08■■□□□ 1.13
SMIM4-205ENST00000491607 CTR9Q6PD62 1173 aa22.08■■□□□ 1.13
SMIM4-205ENST00000491607 KBTBD3Q8NAB2 608 aa22.08■■□□□ 1.13
SMIM4-205ENST00000491607 LPAR1Q92633 364 aa22.08■■□□□ 1.13
SMIM4-205ENST00000491607 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SMIM4-205ENST00000491607 OGDHLQ9ULD0 1010 aa22.08■■□□□ 1.13
SMIM4-205ENST00000491607 TMX2Q9Y320 296 aa22.08■■□□□ 1.13
SMIM4-205ENST00000491607 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.07■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.07■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 MYH7P12883 1935 aa22.07■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 FLOT1O75955 427 aa22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 MFSD14CQ5VZR4 134 aa22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 VCPKMTQ9H867 229 aa22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 MYH8P13535 1937 aa22.06■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 GRB14Q14449 540 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 PLS1Q14651 629 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.05■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 RAD21O60216 631 aa22.04■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 EEF2P13639 858 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 DSG3P32926 999 aa22.04■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.04■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 APPBP2Q92624 585 aa22.04■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 OSBP2Q969R2 916 aa22.04■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 KANSL2Q9H9L4 492 aa22.04■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.03■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 DPP9Q86TI2 863 aa22.03■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 MB21D1Q8N884 522 aa22.03■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.03■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 ATG4CQ96DT6 458 aa22.03■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa22.03■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.02■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 HOXC6P09630 235 aa22.02■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 ERCC3P19447 782 aa22.02■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 ADORA2AP29274 412 aa22.02■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 CNGA1P29973 690 aa22.02■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 LHX8Q68G74 356 aa22.02■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.02■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.02■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 GOPCQ9HD26 462 aa22.02■■□□□ 1.12
SMIM4-205ENST00000491607 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.01■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 GPAA1O43292 621 aa22.01■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 APPP05067 770 aa22.01■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 CYP2C19P33261 490 aa22.01■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 TDO2P48775 406 aa22.01■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 SBK1Q52WX2 424 aa22.01■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.01■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.01■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.01■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 M0R2C6 588 aa22■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 ERC2O15083 957 aa22■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 STRNO43815 780 aa22■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 RRP1P56182 461 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 PRO3102Q9H379 93 aa22■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 MROH8Q9H579 483 aa22■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 GNAT2P19087 354 aa21.99■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 STAP2Q9UGK3 403 aa21.99■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 PFASO15067 1338 aa21.99■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 CEP290O15078 2479 aa21.98■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 RASA1P20936 1047 aa21.98■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 FAM83BQ5T0W9 1011 aa21.98■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 PI4K2BQ8TCG2 481 aa21.98■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 FSD1Q9BTV5 496 aa21.98■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 FBXO28Q9NVF7 368 aa21.98■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 SLC5A4Q9NY91 659 aa21.98■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 RLFQ13129 1914 aa21.98■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 ALPK3Q96L96 1907 aa21.98■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.98■■□□□ 1.11
SMIM4-205ENST00000491607 MSCO60682 206 aa21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms