RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491139.5

NELFE-210, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-210ENST00000491139 SLC5A4Q9NY91 659 aa25.32■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 LTBP2Q14767 1821 aa25.32■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 SEPT4O43236 478 aa25.31■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 SHCBP1Q8NEM2 672 aa25.31■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.31■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 SPATC1LQ9H0A9 340 aa25.31■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 SEMA6BQ9H3T3 888 aa25.31■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 ANTXR1Q9H6X2 564 aa25.31■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 C1orf115Q9H7X2 142 aa25.31■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 ERCC3P19447 782 aa25.3■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 TRIM60Q495X7 471 aa25.3■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 C9orf50Q5SZB4 431 aa25.3■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa25.3■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 BADQ92934 168 aa25.3■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 VCANP13611 3396 aa25.3■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 ZNF236Q9UL36 1845 aa25.29■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 A0A1W2PRG0 241 aa25.29■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 COBLO75128 1261 aa25.29■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 GABPAQ06546 454 aa25.29■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 SNX17Q15036 470 aa25.29■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP25.29■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 TTC28Q96AY4 2481 aa25.28■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa25.28■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 ADCYAP1R1P41586 468 aa25.28■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 MB21D1Q8N884 522 aa25.28■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 MROH8Q9H579 483 aa25.28■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 PDLIM7Q9NR12 457 aa25.27■■□□□ 1.64
NELFE-210ENST00000491139 PLS1Q14651 629 aa25.26■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 LRRC41Q15345 812 aa25.26■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa25.26■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 NCAPG2Q86XI2 1143 aa25.26■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 ABRAQ8N0Z2 381 aa25.26■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 FERMT2Q96AC1 680 aa25.26■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 MCM9Q9NXL9 1143 aa25.26■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 EYSQ5T1H1 3165 aa25.26■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 C1orf53Q5VUE5 145 aa25.25■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa25.25■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 TRIM43BA6NCK2 446 aa25.24■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 DSG3P32926 999 aa25.24■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 AACSQ86V21 672 aa25.24■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 MYLIPQ8WY64 445 aa25.24■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa25.24■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 FLOT1O75955 427 aa25.23■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 TLE2Q04725 743 aa25.23■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 FAM47AQ5JRC9 791 aa25.23■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.23■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.23■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 MAML3Q96JK9 1138 aa25.23■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 SMCHD1A6NHR9 2005 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 NAV1Q8NEY1 1877 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 FCER1AP12319 257 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 EVX2Q03828 476 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 ATG4CQ96DT6 458 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 TACC3Q9Y6A5 838 aa25.22■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.21■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 PDE6AP16499 860 aa25.21■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.21■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.21■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 SH2D4AQ9H788 454 aa25.21■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.21■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa25.21■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 NRBP1Q9UHY1 535 aa25.21■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 PHF24Q9UPV7 400 aa25.21■■□□□ 1.63
NELFE-210ENST00000491139 RARBP10826 455 aa25.2■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 FOSL2P15408 326 aa25.2■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 SPICE1Q8N0Z3 855 aa25.2■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.2■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 SWAP70Q9UH65 585 aa25.2■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 TMX2Q9Y320 296 aa25.2■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 CDH23Q9H251 3354 aa25.19■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 SLC25A27O95847 323 aa25.19■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 CLTBP09497 229 aa25.19■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 RNF180Q86T96 592 aa25.19■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 SLC44A5Q8NCS7 719 aa25.19■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 VCPKMTQ9H867 229 aa25.19■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.19■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.18■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 CYP2D6P10635 497 aa25.18■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 ICA1Q05084 483 aa25.18■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.18■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 TMEM265A0A087WTH1 108 aa25.17■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 ITGB8P26012 769 aa25.17■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 TMEM132BQ14DG7 1078 aa25.17■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 CEP85Q6P2H3 762 aa25.17■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.17■■□□□ 1.62
NELFE-210ENST00000491139 DYNLL2Q96FJ2 89 aa25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms