RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490425.1

NISCH-214, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 5

Gene NISCH, Length 559 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-214ENST00000490425 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.31□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 RAD21O60216 631 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 FLT3LGP49771 235 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 RGS19P49795 217 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 ERVK-9P63128 1117 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 ERVK-24P63145 666 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 PDE4BQ07343 736 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 Q3C1V9 767 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP14.3□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 ZNF333Q96JL9 665 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 SH2D4AQ9H788 454 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 VCPKMTQ9H867 229 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 ZNF287Q9HBT7 754 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 CCDC171Q6TFL3 1326 aa14.3□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 CNMDO75829 334 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 FGAP02671 866 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 ALX1Q15699 326 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 TTC22Q5TAA0 569 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 NBPF11Q86T75 865 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 COA7Q96BR5 231 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 PORCNQ9H237 461 aa14.29□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 POTEFA5A3E0 1075 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 TSPY3P0CV98 308 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 TSPY8P0CW00 308 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 ELNP15502 786 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 GRK4P32298 578 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 HAND2P61296 217 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 TFAP4Q01664 338 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 LPAR1Q92633 364 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 CEP95Q96GE4 821 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 BTBD7Q9P203 1132 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 NYAP2Q9P242 653 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP14.28□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.28□□□□□ -0.12
NISCH-214ENST00000490425 HIP1O00291 1037 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 WDR46O15213 610 aaKnown RBP14.27□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 ADCY3O60266 1144 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 FLOT1O75955 427 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 COG2Q14746 738 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 MTFR1Q15390 333 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 GOPCQ9HD26 462 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 MTMR4Q9NYA4 1195 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP14.27□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 ANAPC4Q9UJX5 808 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 GJD2Q9UKL4 321 aa14.27□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 RLFQ13129 1914 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP14.26□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 LBX2Q6XYB7 198 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 SKAP1Q86WV1 359 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.26□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 ATG4CQ96DT6 458 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 IL25Q9H293 177 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.26□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 PLIN4Q96Q06 1357 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 TSPY2A6NKD2 308 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 F5H6K3 240 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 NMT2O60551 498 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 TTLL1O95922 423 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 NDUFB10O96000 172 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.25□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 MAPK4P31152 587 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 DSG3P32926 999 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 KLRC3Q07444 240 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 IRF5Q13568 498 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 WDR78Q5VTH9 848 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 NBPF3Q9H094 633 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.25□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 TOMM22Q9NS69 142 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 MYH4Q9Y623 1939 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 PLXNB2O15031 1838 aa14.25□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 ZMYM6O95789 1325 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 ORC4O43929 436 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 CYP2B6P20813 491 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 CCNA1P78396 465 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 GPR142Q7Z601 462 aa14.24□□□□□ -0.13
NISCH-214ENST00000490425 TBC1D10CQ8IV04 446 aa14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms