RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489694.5

RARB-208, Transcript of retinoic acid receptor beta, humanhuman

TSL 4

Gene RARB, Length 574 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARB-208ENST00000489694 FBXO33Q7Z6M2 555 aa5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 ZSWIM9Q86XI8 627 aa5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 KDM6BO15054 1643 aa5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 IQGAP3Q86VI3 1631 aa5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 ATP7AQ04656 1500 aa5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 FAM135AQ9P2D6 1515 aa5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa5.48□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 GNAT3A8MTJ3 354 aa5.47□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 FANCGO15287 622 aa5.47□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 ZP2Q05996 745 aa5.47□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 ARMCX6Q7L4S7 300 aa5.47□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 C12orf40Q86WS4 652 aa5.47□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 KSR1Q8IVT5 923 aa5.47□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 AK5Q9Y6K8 562 aa5.47□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 BCORL1Q5H9F3 1711 aa5.47□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa5.47□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa5.47□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 POGZQ7Z3K3 1410 aa5.47□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa5.47□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP5.47□□□□□ -1.53
RARB-208ENST00000489694 DEPDC5O75140 1603 aa5.46□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 EOMESO95936 686 aa5.46□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 MESP2Q0VG99 397 aa5.46□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 SCARA3Q6AZY7 606 aa5.46□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa5.46□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 KCT2Q8NC54 265 aa5.46□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 GAL3ST3Q96A11 431 aa5.46□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP5.46□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 PARP2Q9UGN5 583 aa5.46□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 PCDHA4Q9UN74 947 aa5.46□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 CTNND2Q9UQB3 1225 aa5.46□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa5.46□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa5.46□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 LMTK2Q8IWU2 1503 aa5.45□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 LRRC10BA6NIK2 292 aa5.45□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 DAB2P98082 770 aa5.45□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 FGD1P98174 961 aa5.45□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 LRRC14Q15048 493 aa5.45□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 KCNMB1Q16558 191 aa5.45□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 CCDC27Q2M243 656 aa5.45□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 SV2BQ7L1I2 683 aa5.45□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 CDC37L1Q7L3B6 337 aa5.45□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 AFAP1Q8N556 730 aa5.45□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 ELMO3Q96BJ8 720 aa5.45□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 SIN3AQ96ST3 1273 aa5.45□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 SLC38A3Q99624 504 aa5.45□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 FOXQ1Q9C009 403 aa5.45□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 CCDC144AA2RUR9 1427 aa5.45□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 VWDEQ8N2E2 1590 aa5.45□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa5.44□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 PTPRTO14522 1441 aa5.44□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 LRIG2O94898 1065 aa5.44□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 LCE4AQ5TA78 99 aa5.44□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 MEI1Q5TIA1 1274 aa5.44□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 TTBK2Q6IQ55 1244 aa5.44□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP5.44□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 FAM84AQ96KN4 292 aa5.44□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 FAM161BQ96MY7 647 aa5.44□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 FAM53CQ9NYF3 392 aa5.44□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 HECW2Q9P2P5 1572 aa5.44□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 REREQ9P2R6 1566 aa5.44□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 CYP8B1Q9UNU6 501 aa5.44□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 A2MP01023 1474 aa5.44□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa5.43□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 DIP2BQ9P265 1576 aa5.43□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa5.43□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 SLITRK5O94991 958 aa5.43□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 CTSHP09668 335 aa5.43□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 PSMD2Q13200 908 aa5.43□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 LRFN4Q6PJG9 635 aa5.43□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 C22orf34Q6ZV56 151 aa5.43□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 TMC4Q7Z404 712 aa5.43□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 ZNF507Q8TCN5 953 aa5.43□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 FBXO41Q8TF61 875 aa5.43□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 LMCD1Q9NZU5 365 aa5.43□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 TET3O43151 1660 aa5.43□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa5.42□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa5.42□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 INPP5AQ14642 412 aa5.42□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 MLANAQ16655 118 aa5.42□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 CYFIP1Q7L576 1253 aa5.42□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 MFSD4AQ8N468 514 aa5.42□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.42□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 FBRSQ9HAH7 460 aa5.42□□□□□ -1.54
RARB-208ENST00000489694 SEMA3GQ9NS98 782 aa5.42□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms