RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489442.5

CCL28-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 28, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCL28, Length 1,342 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28-202ENST00000489442 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
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CCL28-202ENST00000489442 SPICE1Q8N0Z3 855 aa15.9■□□□□ 0.14
CCL28-202ENST00000489442 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa15.9■□□□□ 0.14
CCL28-202ENST00000489442 LPAR1Q92633 364 aa15.9■□□□□ 0.14
CCL28-202ENST00000489442 COA7Q96BR5 231 aa15.9■□□□□ 0.14
CCL28-202ENST00000489442 PAGR1Q9BTK6 254 aa15.9■□□□□ 0.14
CCL28-202ENST00000489442 GOPCQ9HD26 462 aa15.9■□□□□ 0.14
CCL28-202ENST00000489442 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa15.9■□□□□ 0.14
CCL28-202ENST00000489442 HTTP42858 3142 aa15.9■□□□□ 0.14
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CCL28-202ENST00000489442 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
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CCL28-202ENST00000489442 PRKCZQ05513 592 aa15.87■□□□□ 0.13
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CCL28-202ENST00000489442 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CCL28-202ENST00000489442 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa15.87■□□□□ 0.13
CCL28-202ENST00000489442 ZMYM6O95789 1325 aa15.86■□□□□ 0.13
CCL28-202ENST00000489442 WDR46O15213 610 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CCL28-202ENST00000489442 PEX10O60683 326 aa15.86■□□□□ 0.13
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CCL28-202ENST00000489442 HAND2P61296 217 aa15.86■□□□□ 0.13
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CCL28-202ENST00000489442 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CCL28-202ENST00000489442 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa15.86■□□□□ 0.13
CCL28-202ENST00000489442 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa15.86■□□□□ 0.13
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CCL28-202ENST00000489442 INCENPQ9NQS7 918 aa15.86■□□□□ 0.13
CCL28-202ENST00000489442 MTMR4Q9NYA4 1195 aa15.86■□□□□ 0.13
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CCL28-202ENST00000489442 ZNF213O14771 459 aa15.85■□□□□ 0.13
CCL28-202ENST00000489442 MYCP01106 439 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
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CCL28-202ENST00000489442 Q3C1V9 767 aa15.85■□□□□ 0.13
CCL28-202ENST00000489442 WDR78Q5VTH9 848 aa15.85■□□□□ 0.13
CCL28-202ENST00000489442 MFSD6Q6ZSS7 791 aa15.85■□□□□ 0.13
CCL28-202ENST00000489442 SH3TC2Q8TF17 1288 aa15.85■□□□□ 0.13
CCL28-202ENST00000489442 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP15.85■□□□□ 0.13
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CCL28-202ENST00000489442 ORC4O43929 436 aa15.84■□□□□ 0.13
CCL28-202ENST00000489442 KLRC3Q07444 240 aa15.84■□□□□ 0.13
CCL28-202ENST00000489442 FAM83BQ5T0W9 1011 aa15.84■□□□□ 0.13
CCL28-202ENST00000489442 LBX2Q6XYB7 198 aa15.84■□□□□ 0.13
CCL28-202ENST00000489442 ARMC5Q96C12 935 aa15.84■□□□□ 0.13
CCL28-202ENST00000489442 DSCC1Q9BVC3 393 aa15.84■□□□□ 0.13
CCL28-202ENST00000489442 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.84■□□□□ 0.13
CCL28-202ENST00000489442 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
CCL28-202ENST00000489442 CTNNA3Q9UI47 895 aa15.84■□□□□ 0.13
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CCL28-202ENST00000489442 PLS1Q14651 629 aa15.83■□□□□ 0.12
CCL28-202ENST00000489442 AKNAD1Q5T1N1 836 aa15.83■□□□□ 0.12
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CCL28-202ENST00000489442 MB21D1Q8N884 522 aa15.83■□□□□ 0.12
CCL28-202ENST00000489442 SLAIN1Q8ND83 568 aa15.83■□□□□ 0.12
CCL28-202ENST00000489442 MKL1Q969V6 931 aa15.83■□□□□ 0.12
CCL28-202ENST00000489442 PLIN4Q96Q06 1357 aa15.83■□□□□ 0.12
CCL28-202ENST00000489442 RAD50Q92878 1312 aa15.82■□□□□ 0.12
CCL28-202ENST00000489442 NDUFB10O96000 172 aa15.82■□□□□ 0.12
CCL28-202ENST00000489442 PCP11498 1178 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
CCL28-202ENST00000489442 UBXN2AP68543 259 aa15.82■□□□□ 0.12
CCL28-202ENST00000489442 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP15.82■□□□□ 0.12
CCL28-202ENST00000489442 PLEKHH3Q7Z736 793 aa15.82■□□□□ 0.12
CCL28-202ENST00000489442 ZNF333Q96JL9 665 aa15.82■□□□□ 0.12
CCL28-202ENST00000489442 NUDT12Q9BQG2 462 aa15.82■□□□□ 0.12
CCL28-202ENST00000489442 PORCNQ9H237 461 aa15.82■□□□□ 0.12
CCL28-202ENST00000489442 BTBD7Q9P203 1132 aa15.82■□□□□ 0.12
CCL28-202ENST00000489442 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa15.82■□□□□ 0.12
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