RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 ANKRD24Q8TF21 1146 aa5.84□□□□□ -1.47
SENP6-210ENST00000487548 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa5.84□□□□□ -1.47
SENP6-210ENST00000487548 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa5.84□□□□□ -1.47
SENP6-210ENST00000487548 EBF1Q9UH73 591 aa5.84□□□□□ -1.47
SENP6-210ENST00000487548 CORINQ9Y5Q5 1042 aa5.84□□□□□ -1.47
SENP6-210ENST00000487548 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa5.84□□□□□ -1.47
SENP6-210ENST00000487548 SDHBP21912 280 aa5.83□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 SPPL2CQ8IUH8 684 aa5.83□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 FAM13CQ8NE31 585 aa5.83□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 FEZF2Q8TBJ5 459 aa5.83□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 GPR62Q9BZJ7 368 aa5.83□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 IRAK3Q9Y616 596 aa5.83□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 ADAMTS20P59510 1910 aa5.82□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 OR14I1A6ND48 311 aa5.82□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 SASH1O94885 1247 aa5.82□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 EPHB3P54753 998 aa5.82□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 DUSP4Q13115 394 aa5.82□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa5.82□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 TMEM151BQ8IW70 566 aa5.82□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa5.82□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 SHISA3A0PJX4 238 aa5.81□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 USP2O75604 605 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 PLCG1P19174 1290 aa5.81□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 RPL10P27635 214 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 LIG3P49916 1009 aa5.81□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 RPS26P62854 115 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 CHRNEQ04844 493 aa5.81□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 NR0B2Q15466 257 aa5.81□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 DBX2Q6ZNG2 339 aa5.81□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 SIRT5Q9NXA8 310 aa5.81□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 RTEL1Q9NZ71 1219 aa5.81□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 LDHBP07195 334 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 P4HBP07237 508 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 TEKQ02763 1124 aa5.8□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa5.8□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 AGMOQ6ZNB7 445 aa5.8□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 ANKS4BQ8N8V4 417 aa5.8□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 SYT8Q8NBV8 401 aa5.8□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 SHISA4Q96DD7 197 aa5.8□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 SIGLEC10Q96LC7 697 aa5.8□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 XYLT2Q9H1B5 865 aa5.8□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 KLHL3Q9UH77 587 aa5.8□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 ZMYM5Q9UJ78 669 aa5.8□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 TLR6Q9Y2C9 796 aa5.8□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 TACC3Q9Y6A5 838 aa5.8□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 F6X3S4 739 aa5.79□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 EFEMP2O95967 443 aa5.79□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 YARSP54577 528 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 SNX17Q15036 470 aa5.79□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 SLC14A2Q15849 920 aa5.79□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 GGNQ86UU5 652 aa5.79□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 ADAM30Q9UKF2 790 aa5.79□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 CELA3BP08861 270 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 CHMP4BP1P59074 171 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 WAPLQ7Z5K2 1190 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 C14orf37Q86TY3 774 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 RNF141Q8WVD5 230 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 ASB16Q96NS5 453 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 ADAM7Q9H2U9 754 aa5.78□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
SENP6-210ENST00000487548 NOTOA8MTQ0 251 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 FKTNO75072 461 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 VIPR1P32241 457 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 KRTAP10-2P60368 255 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 PDE4CQ08493 712 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 MEI1Q5TIA1 1274 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 CEP128Q6ZU80 1094 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 NLRX1Q86UT6 975 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 CXorf38Q8TB03 319 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 KREMEN1Q96MU8 473 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 RNF19AQ9NV58 838 aa5.77□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 SLC22A31A6NKX4 558 aa5.76□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 BPNT1O95861 308 aa5.76□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 GNA15P30679 374 aa5.76□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 PHACTR4Q8IZ21 702 aa5.76□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 LINC01599Q8WXQ3 324 aa5.76□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 G6PC3Q9BUM1 346 aa5.76□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 FOXP3Q9BZS1 431 aa5.76□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa5.75□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa5.75□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 GRIN3BO60391 1043 aa5.75□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 ERICH6BQ5W0A0 696 aa5.75□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 CNTD2Q9H8S5 307 aa5.75□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 N4BP3O15049 544 aa5.74□□□□□ -1.49
SENP6-210ENST00000487548 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.3 ms