RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 PSMD14O00487 310 aa11.99□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 RAD17O75943 681 aa11.99□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 YEATS4O95619 227 aa11.99□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 VIL1P09327 827 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 TOP1P11387 765 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP11.99□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 NOVP48745 357 aa11.99□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 MRE11P49959 708 aa11.99□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 CXCL9Q07325 125 aa11.99□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 TPRNQ4KMQ1 711 aa11.99□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 JMYQ8N9B5 988 aa11.99□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 LZTS2Q9BRK4 669 aa11.99□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP11.99□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP11.99□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 POLR3EQ9NVU0 708 aa11.99□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 HDAC9Q9UKV0 1011 aa11.99□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa11.99□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 V9GY48 417 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 ENTPD3O75355 529 aa11.98□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 SHMT1P34896 483 aa11.98□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 EPS15P42566 896 aa11.98□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 NASPP49321 788 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 CACNB3P54284 484 aa11.98□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 STK38Q15208 465 aa11.98□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 PKN1Q16512 942 aa11.98□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa11.98□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 LRSAM1Q6UWE0 723 aa11.98□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 GAS2L3Q86XJ1 694 aa11.98□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP11.98□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 BICD2Q8TD16 824 aa11.98□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNG4Q8TDN1 519 aa11.98□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 CEP95Q96GE4 821 aa11.98□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 PGBD1Q96JS3 809 aa11.98□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 GMLQ99445 158 aa11.98□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 GPRC5DQ9NZD1 345 aa11.98□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 FAM198AQ9UFP1 575 aa11.98□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 ATRNL1Q5VV63 1379 aa11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 AKR1B1P15121 316 aa11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 ME1P48163 572 aa11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 TCP10Q12799 353 aa11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 ANO1Q5XXA6 986 aa11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 NOSTRINQ8IVI9 506 aa11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 ZFPM1Q8IX07 1006 aa11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 OGFOD1Q8N543 542 aa11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 LINC00301Q8NCQ3 95 aa11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 AGBL3Q8NEM8 1001 aa11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC17Q96LX7 622 aa11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 TRIM34Q9BYJ4 488 aa11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 GRPEL1Q9HAV7 217 aa11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 CREBZFQ9NS37 354 aa11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 TMOD2Q9NZR1 351 aa11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 PI4KBQ9UBF8 816 aa11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 KCNJ14Q9UNX9 436 aa11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 CLIC4Q9Y696 253 aa11.97□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 TRPM7Q96QT4 1865 aa11.96□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 SHTN1A0MZ66 631 aa11.96□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 SPDYE2BA6NHP3 402 aa11.96□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 BTBD18B2RXH4 712 aa11.96□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 SPDYE6P0CI01 402 aa11.96□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 SCG2P13521 617 aa11.96□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 LIG1P18858 919 aa11.96□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 DLGAP5Q15398 846 aa11.96□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP11.96□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 CIAPIN1Q6FI81 312 aa11.96□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 PHF20Q9BVI0 1012 aa11.96□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 BRMS1Q9HCU9 246 aa11.96□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 MTMR4Q9NYA4 1195 aa11.96□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 VPS54Q9P1Q0 977 aa11.96□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 MAD2L2Q9UI95 211 aa11.96□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 MYH6P13533 1939 aa11.96□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 SIPA1L1O43166 1804 aa11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 CNTNAP1P78357 1384 aa11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1W2PQ27 194 aa11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1W2PQ64 194 aa11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 A0A1W2PQD8 194 aa11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 SPTLC2O15270 562 aa11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 TTLL1O95922 423 aa11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 KRT2P35908 639 aa11.95□□□□□ -0.5
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa11.95□□□□□ -0.5
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