RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 TRIM34Q9BYJ4 488 aa10.33□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 ANTXR1Q9H6X2 564 aa10.33□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 C1orf115Q9H7X2 142 aa10.33□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 GINM1Q9NU53 330 aa10.33□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 BTBD7Q9P203 1132 aa10.33□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa10.33□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa10.33□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 ALPK3Q96L96 1907 aa10.33□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 PLXNB2O15031 1838 aa10.33□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 USP17L15C9J2P7 530 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 USP17L13C9JLJ4 530 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 USP17L11C9JVI0 530 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 USP17L18D6R9N7 530 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 USP17L22D6RA61 530 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 USP17L17D6RBQ6 530 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 USP17L19D6RCP7 530 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 USP17L20D6RJB6 530 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 POTEB2H3BUK9 544 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 PTPREP23469 700 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 GUCY1A2P33402 732 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 USP17L24Q0WX57 530 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 C12orf42Q96LP6 360 aa10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 A0A0C4DFX4 3053 aa10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 IGHA2P01877 340 aa10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 HLA-DOAP06340 250 aa10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 CYP2C19P33261 490 aa10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 PLCD1P51178 756 aa10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 RAB3GAP1Q15042 981 aa10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 WDR78Q5VTH9 848 aa10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 MAGEB6Q8N7X4 407 aa10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 APBA2Q99767 749 aa10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 LOC285556D6RIA3 1793 aa10.31□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 SIPA1L1O43166 1804 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 A0A1W2PRG0 241 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 SLC15A5A6NIM6 579 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 IDH1O75874 414 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 VCAM1P19320 739 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 CNGA1P29973 690 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 SHMT1P34896 483 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 USP5P45974 858 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 ATP2B2Q01814 1243 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 ABCB5Q2M3G0 1257 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 MFSD14CQ5VZR4 134 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 ANO1Q5XXA6 986 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 FAM161BQ96MY7 647 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 GUCD1Q96NT3 240 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 HOXC6P09630 235 aa10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 SEPT2Q15019 361 aa10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 LBX2Q6XYB7 198 aa10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 OXER1Q8TDS5 423 aa10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 LPAR1Q92633 364 aa10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 FEZ1Q99689 392 aa10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 SERPINB13Q9UIV8 391 aa10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 COBLO75128 1261 aa10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 USP14P54578 494 aa10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 RTP1P59025 263 aa10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 CCNA1P78396 465 aa10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 GRB14Q14449 540 aa10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 SHHQ15465 462 aa10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 TTC6Q86TZ1 520 aa10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 SIAH1Q8IUQ4 282 aa10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 EHD4Q9H223 541 aa10.28□□□□□ -0.76
CTPS1-208ENST00000479480 SMIM22K7EJ46 135 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-208ENST00000479480 IGSF3O75054 1194 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-208ENST00000479480 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-208ENST00000479480 CYP2D6P10635 497 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-208ENST00000479480 RLBP1P12271 317 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-208ENST00000479480 CYBAP13498 195 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-208ENST00000479480 GABPAQ06546 454 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-208ENST00000479480 C9orf50Q5SZB4 431 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-208ENST00000479480 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-208ENST00000479480 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-208ENST00000479480 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
CTPS1-208ENST00000479480 CABP5Q9NP86 173 aa10.27□□□□□ -0.77
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