RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479350.1

HIVEP3-204, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene HIVEP3, Length 940 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP3-204ENST00000479350 MTMR7Q9Y216 660 aa15.81■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 TMX2Q9Y320 296 aa15.81■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 CYP21A2P08686 494 aa15.8■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 OSBPP22059 807 aa15.8■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa15.8■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 VCPKMTQ9H867 229 aa15.8■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 IL17RBQ9NRM6 502 aa15.8■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 MTMR4Q9NYA4 1195 aa15.8■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 PNMA3Q9UL41 463 aa15.8■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa15.8■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 KDM4AO75164 1064 aa15.79■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 FGRP09769 529 aa15.79■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 SP3Q02447 781 aa15.79■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP15.79■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 FAM83BQ5T0W9 1011 aa15.79■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP15.79■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 SH2D4AQ9H788 454 aa15.79■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 NYAP2Q9P242 653 aa15.79■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 STX8Q9UNK0 236 aa15.79■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 TTLL1O95922 423 aa15.78■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 NDUFB10O96000 172 aa15.78■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 CTGFP29279 349 aa15.78■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 HERVK_113P62684 666 aa15.78■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 C17orf99Q6UX52 265 aa15.78■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 STOX1Q6ZVD7 989 aa15.78■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 MAP4K1Q92918 833 aa15.78■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 PAGR1Q9BTK6 254 aa15.78■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 GOPCQ9HD26 462 aa15.78■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 MYH4Q9Y623 1939 aa15.78■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 USP17L15C9J2P7 530 aa15.77■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 USP17L13C9JLJ4 530 aa15.77■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 USP17L11C9JVI0 530 aa15.77■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 USP17L18D6R9N7 530 aa15.77■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 USP17L22D6RA61 530 aa15.77■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 USP17L17D6RBQ6 530 aa15.77■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 USP17L19D6RCP7 530 aa15.77■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 USP17L20D6RJB6 530 aa15.77■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 BCRP11274 1271 aa15.77■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP15.77■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 USP17L24Q0WX57 530 aa15.77■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 POTEEQ6S8J3 1075 aa15.77■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 ESR2Q92731 530 aa15.77■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 TXNRD2Q9NNW7 524 aa15.77■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 FBXO28Q9NVF7 368 aa15.77■□□□□ 0.12
HIVEP3-204ENST00000479350 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 SLC27A2O14975 620 aa15.76■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa15.76■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 CYB5R4Q7L1T6 521 aa15.76■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 ERO1AQ96HE7 468 aa15.76■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 TRIM17Q9Y577 477 aa15.76■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 E7EWF7 191 aa15.75■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 F5H6K3 240 aa15.75■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 WDR46O15213 610 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 FLOT1O75955 427 aa15.75■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 PCP11498 1178 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 KLRC3Q07444 240 aa15.75■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 CREB3L3Q68CJ9 461 aa15.75■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 SLFN13Q68D06 897 aa15.75■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 CHST3Q7LGC8 479 aa15.75■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 LPAR1Q92633 364 aa15.75■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 ATG4CQ96DT6 458 aa15.75■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 CNMDO75829 334 aa15.74■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 RCSD1Q6JBY9 416 aa15.74■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 OTOP1Q7RTM1 612 aa15.74■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 TNS4Q8IZW8 715 aa15.74■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 TRIM47Q96LD4 638 aa15.74■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 TMEM47Q9BQJ4 181 aa15.74■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 KRT23Q9C075 422 aa15.74■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 MCOLN1Q9GZU1 580 aa15.74■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 ZSWIM5Q9P217 1185 aa15.74■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 TNKSO95271 1327 aa15.73■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 MCCP23508 829 aa15.73■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 PSMC4P43686 418 aa15.73■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP15.73■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 FAM110CQ1W6H9 321 aa15.73■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 CCDC96Q2M329 555 aa15.73■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa15.73■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 CNNM2Q9H8M5 875 aa15.73■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 EFCC1Q9HA90 598 aa15.73■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 BTBD7Q9P203 1132 aa15.73■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 RBPJLQ9UBG7 517 aa15.73■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 A0A0G2JMZ2 1700 aa15.73■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 TRDNQ13061 729 aa15.72■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 KIF22Q14807 665 aa15.72■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 NECTIN1Q15223 517 aa15.72■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 KCTD1Q719H9 257 aa15.72■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 MKL1Q969V6 931 aa15.72■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP15.72■□□□□ 0.11
HIVEP3-204ENST00000479350 UBAC1Q9BSL1 405 aa15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.5 ms