RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478378.5

TIMM17A-202, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 17A, humanhuman

TSL 3

Gene TIMM17A, Length 821 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM17A-202ENST00000478378 LRRC41Q15345 812 aa8.25□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 LBX2Q6XYB7 198 aa8.25□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa8.25□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 PPM1EQ8WY54 764 aa8.25□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 SSH1Q8WYL5 1049 aa8.25□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 FERMT2Q96AC1 680 aa8.25□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 TIFAQ96CG3 184 aa8.25□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 NEUROD6Q96NK8 337 aa8.25□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 ZNF576Q9H609 170 aa8.25□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 BTBD7Q9P203 1132 aa8.25□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 PALD1Q9ULE6 856 aa8.25□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 TACC3Q9Y6A5 838 aa8.25□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 KIAA0355O15063 1070 aa8.24□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 IGHA2P01877 340 aa8.24□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 EPHB4P54760 987 aa8.24□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 MAP3K12Q12852 859 aa8.24□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 RAB3GAP1Q15042 981 aa8.24□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 FAM47AQ5JRC9 791 aa8.24□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 AKNAD1Q5T1N1 836 aa8.24□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 POTEGQ6S5H5 508 aa8.24□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 ASB2Q96Q27 587 aa8.24□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa8.24□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 SLC5A4Q9NY91 659 aa8.24□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 PHF24Q9UPV7 400 aa8.24□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 ROBO3Q96MS0 1386 aa8.23□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 STRNO43815 780 aa8.23□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa8.23□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 RARBP10826 455 aa8.23□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 ITGB8P26012 769 aa8.23□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 MCAMP43121 646 aa8.23□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 CCDC174Q6PII3 467 aa8.23□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa8.23□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 RNF180Q86T96 592 aa8.23□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa8.23□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 SMC4Q9NTJ3 1288 aa8.23□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 TMEM39AQ9NV64 488 aa8.23□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 LRRC37A2A6NM11 1700 aa8.23□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 A0A1W2PQY0 241 aa8.22□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 SRGAP3O43295 1099 aa8.22□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 PPP4CP60510 307 aa8.22□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 ABCB5Q2M3G0 1257 aa8.22□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 ALDH1L2Q3SY69 923 aa8.22□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 ADGRA1Q86SQ6 560 aa8.22□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 SHCBP1Q8NEM2 672 aa8.22□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa8.22□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 TANGO6Q9C0B7 1094 aa8.22□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 SPATC1LQ9H0A9 340 aa8.22□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 PRDM12Q9H4Q4 367 aa8.22□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 SERPINB13Q9UIV8 391 aa8.22□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.22□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
TIMM17A-202ENST00000478378 DCDC2CA8MYV0 355 aa8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 COBLO75128 1261 aa8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 ERCC3P19447 782 aa8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 USP5P45974 858 aa8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP8.21□□□□□ -1.11e-6■■□□□ 12.6
TIMM17A-202ENST00000478378 PLS1Q14651 629 aa8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 TTC39AQ5SRH9 613 aa8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 TATDN1Q6P1N9 297 aa8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 ABRAQ8N0Z2 381 aa8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 MB21D1Q8N884 522 aa8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 SLC44A5Q8NCS7 719 aa8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 ACER1Q8TDN7 264 aa8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 MAML3Q96JK9 1138 aa8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 MEIS3Q99687 375 aa8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 PBX4Q9BYU1 374 aa8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 EHD4Q9H223 541 aa8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 MROH8Q9H579 483 aa8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 CABP5Q9NP86 173 aa8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 SNRKQ9NRH2 765 aa8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 NRBP1Q9UHY1 535 aa8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 ZNF521Q96K83 1311 aa8.21□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 E9PSI1 815 aa8.2□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 PGK1P00558 417 aa8.2□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 TIMP1P01033 207 aa8.2□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 FCER1AP12319 257 aa8.2□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 IGFBP4P22692 258 aa8.2□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 PBX2P40425 430 aa8.2□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 COG2Q14746 738 aa8.2□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 RAB30Q15771 203 aa8.2□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa8.2□□□□□ -1.1
TIMM17A-202ENST00000478378 NCAPG2Q86XI2 1143 aa8.2□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms