RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-211ENST00000476336 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
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PRAME-211ENST00000476336 MYPNQ86TC9 1320 aa15.85■□□□□ 0.13
PRAME-211ENST00000476336 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PRAME-211ENST00000476336 WDR46O15213 610 aaKnown RBP15.84■□□□□ 0.13
PRAME-211ENST00000476336 FGAP02671 866 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-211ENST00000476336 TSPY3P0CV98 308 aa15.84■□□□□ 0.13
PRAME-211ENST00000476336 TSPY8P0CW00 308 aa15.84■□□□□ 0.13
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PRAME-211ENST00000476336 TRIM47Q96LD4 638 aa15.84■□□□□ 0.13
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PRAME-211ENST00000476336 RAD50Q92878 1312 aa15.84■□□□□ 0.13
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PRAME-211ENST00000476336 RAET1EQ8TD07 263 aa15.83■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 MKL1Q969V6 931 aa15.83■□□□□ 0.12
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PRAME-211ENST00000476336 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP15.83■□□□□ 0.12
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PRAME-211ENST00000476336 VPS53Q5VIR6 699 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP15.82■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 TANGO6Q9C0B7 1094 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa15.82■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa15.82■□□□□ 0.12
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PRAME-211ENST00000476336 ERVK-24P63145 666 aa15.81■□□□□ 0.12
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PRAME-211ENST00000476336 ERICH6BQ5W0A0 696 aa15.81■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 PXYLP1Q8TE99 480 aa15.81■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.81■□□□□ 0.12
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PRAME-211ENST00000476336 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP15.81■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 ZNF213O14771 459 aa15.8■□□□□ 0.12
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PRAME-211ENST00000476336 MFSD6Q6ZSS7 791 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 STK11IPQ8N1F8 1099 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 SLAIN1Q8ND83 568 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 SOCS4Q8WXH5 440 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 CLIP2Q9UDT6 1046 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa15.8■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 FLOT1O75955 427 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 CTGFP29279 349 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 GRK4P32298 578 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 CTDSPL2Q05D32 466 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 AKNAD1Q5T1N1 836 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 CEP95Q96GE4 821 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 PAGR1Q9BTK6 254 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP15.79■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 LAMA4Q16363 1823 aa15.79■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 PARP14Q460N5 1801 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP15.78■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 F5H6K3 240 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 FDX1P10109 184 aa15.78■□□□□ 0.12
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PRAME-211ENST00000476336 FLT3LGP49771 235 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 UBXN2AP68543 259 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 PRKCZQ05513 592 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 KLRC3Q07444 240 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 CCDC178Q5BJE1 867 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 SPICE1Q8N0Z3 855 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 STAG1Q8WVM7 1258 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 NUDT12Q9BQG2 462 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 TXNRD2Q9NNW7 524 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 TOMM22Q9NS69 142 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa15.78■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 RLFQ13129 1914 aa15.77■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 STRNO43815 780 aa15.77■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP15.77■□□□□ 0.12
PRAME-211ENST00000476336 CHMLP26374 656 aa15.77■□□□□ 0.12
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