RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 MKL1Q969V6 931 aa22.46■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.46■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.46■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 MYPNQ86TC9 1320 aa22.46■■□□□ 1.19
SYF2-203ENST00000474160 PRDM1O75626 825 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 TTLL1O95922 423 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 CHMLP26374 656 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 SRRDQ9UH36 339 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 TFAP4Q01664 338 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 COG2Q14746 738 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 TRIM47Q96LD4 638 aa22.44■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 TSPY2A6NKD2 308 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 ZNF213O14771 459 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 ATP2B2Q01814 1243 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 MB21D1Q8N884 522 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 STAG1Q8WVM7 1258 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa22.43■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 CCNA1P78396 465 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 CAP1Q01518 475 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 MFSD6Q6ZSS7 791 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 COA7Q96BR5 231 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 CEP95Q96GE4 821 aa22.42■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 ERVK-9P63128 1117 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 ERVK-24P63145 666 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 NBPF11Q86T75 865 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.41■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 CTGFP29279 349 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 MAPK4P31152 587 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 NOVP48745 357 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 ARMC5Q96C12 935 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 MGAMO43451 1857 aa22.4■■□□□ 1.18
SYF2-203ENST00000474160 F5H6K3 240 aa22.39■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 SGSM2O43147 1006 aa22.39■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 KLRC3Q07444 240 aa22.39■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 IRF5Q13568 498 aa22.39■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.39■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.39■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa22.39■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 LAMA4Q16363 1823 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 FLOT1O75955 427 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 DSG3P32926 999 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 RAET1EQ8TD07 263 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 ESR2Q92731 530 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 TOMM22Q9NS69 142 aa22.38■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 NDUFB10O96000 172 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 HAND2P61296 217 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 TTC14Q96N46 770 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 CNNM2Q9H8M5 875 aa22.37■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 MYH4Q9Y623 1939 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 GMCL1Q96IK5 515 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 IL25Q9H293 177 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa22.36■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 CNMDO75829 334 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 FDX1P10109 184 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 PRKCZQ05513 592 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 CASC1Q6TDU7 716 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 TBC1D10CQ8IV04 446 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 KRT23Q9C075 422 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 NBPF3Q9H094 633 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 STX8Q9UNK0 236 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 TACC3Q9Y6A5 838 aa22.35■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 COPB2P35606 906 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 FLT3LGP49771 235 aa22.34■■□□□ 1.17
SYF2-203ENST00000474160 Q3C1V9 767 aa22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms