RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472760.1

PRPF40A-208, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF40A, Length 243 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-208ENST00000472760 ATG3Q9NT62 314 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF40A-208ENST00000472760 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa7.3□□□□□ -1.24
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PRPF40A-208ENST00000472760 MSTNO14793 375 aa7.29□□□□□ -1.24
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PRPF40A-208ENST00000472760 PDPK1O15530 556 aa7.29□□□□□ -1.24
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PRPF40A-208ENST00000472760 FBXL18Q96ME1 805 aa7.28□□□□□ -1.24
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PRPF40A-208ENST00000472760 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
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PRPF40A-208ENST00000472760 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 FBXL21Q9UKT6 434 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 KCNH3Q9ULD8 1083 aa7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa7.27□□□□□ -1.25
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PRPF40A-208ENST00000472760 GIMAP6Q6P9H5 292 aa7.25□□□□□ -1.25
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PRPF40A-208ENST00000472760 GBP3Q9H0R5 595 aa7.25□□□□□ -1.25
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PRPF40A-208ENST00000472760 FGD4Q96M96 766 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 DNAJC7Q99615 494 aa7.24□□□□□ -1.25
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PRPF40A-208ENST00000472760 EPN3Q9H201 632 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa7.24□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 PRR33A8MZF0 331 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 CBFA2T2O43439 604 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 PPM1BO75688 479 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 IGHA1P01876 353 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 CD247P20963 164 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.259e-6■■□□□ 12.5
PRPF40A-208ENST00000472760 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 MFSD4AQ8N468 514 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 DTWD2Q8NBA8 298 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 Q96M66 194 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 KLHL25Q9H0H3 589 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 GP6Q9HCN6 339 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 LRP2BPQ9P2M1 347 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 PFDN2Q9UHV9 154 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa7.23□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 TLDC2A0PJX2 215 aa7.22□□□□□ -1.25
PRPF40A-208ENST00000472760 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa7.22□□□□□ -1.25
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