RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 LHX8Q68G74 356 aa23.22■■□□□ 1.31
SHQ1-206ENST00000471526 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa23.21■■□□□ 1.31
SHQ1-206ENST00000471526 SMIM22K7EJ46 135 aa23.21■■□□□ 1.31
SHQ1-206ENST00000471526 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
SHQ1-206ENST00000471526 AKR1B1P15121 316 aa23.21■■□□□ 1.31
SHQ1-206ENST00000471526 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa23.21■■□□□ 1.31
SHQ1-206ENST00000471526 CLEC10AQ8IUN9 316 aa23.21■■□□□ 1.31
SHQ1-206ENST00000471526 NPLOC4Q8TAT6 608 aa23.21■■□□□ 1.31
SHQ1-206ENST00000471526 LRRCC1Q9C099 1032 aa23.21■■□□□ 1.31
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SHQ1-206ENST00000471526 A0A1W2PPC1 479 aa23.2■■□□□ 1.3
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SHQ1-206ENST00000471526 USP17L21D6R901 530 aa23.2■■□□□ 1.3
SHQ1-206ENST00000471526 GRB14Q14449 540 aa23.2■■□□□ 1.3
SHQ1-206ENST00000471526 AMOTL1Q8IY63 956 aa23.2■■□□□ 1.3
SHQ1-206ENST00000471526 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
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SHQ1-206ENST00000471526 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.19■■□□□ 1.3
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SHQ1-206ENST00000471526 CYP2C19P33261 490 aa23.18■■□□□ 1.3
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SHQ1-206ENST00000471526 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.18■■□□□ 1.3
SHQ1-206ENST00000471526 DPP9Q86TI2 863 aa23.18■■□□□ 1.3
SHQ1-206ENST00000471526 CCDC17Q96LX7 622 aa23.18■■□□□ 1.3
SHQ1-206ENST00000471526 TMX2Q9Y320 296 aa23.18■■□□□ 1.3
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SHQ1-206ENST00000471526 FLOT1O75955 427 aa23.17■■□□□ 1.3
SHQ1-206ENST00000471526 COL6A1P12109 1028 aa23.17■■□□□ 1.3
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SHQ1-206ENST00000471526 SPATC1LQ9H0A9 340 aa23.17■■□□□ 1.3
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SHQ1-206ENST00000471526 ERCC3P19447 782 aa23.16■■□□□ 1.3
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SHQ1-206ENST00000471526 VCPKMTQ9H867 229 aa23.16■■□□□ 1.3
SHQ1-206ENST00000471526 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
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SHQ1-206ENST00000471526 ALPK3Q96L96 1907 aa23.13■■□□□ 1.29
SHQ1-206ENST00000471526 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
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SHQ1-206ENST00000471526 COBLO75128 1261 aa23.12■■□□□ 1.29
SHQ1-206ENST00000471526 STK11IPQ8N1F8 1099 aa23.12■■□□□ 1.29
SHQ1-206ENST00000471526 MROH8Q9H579 483 aa23.12■■□□□ 1.29
SHQ1-206ENST00000471526 KANSL2Q9H9L4 492 aa23.12■■□□□ 1.29
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SHQ1-206ENST00000471526 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
SHQ1-206ENST00000471526 TMEM132BQ14DG7 1078 aa23.09■■□□□ 1.29
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SHQ1-206ENST00000471526 GSG1L2A8MUP6 293 aa23.08■■□□□ 1.29
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SHQ1-206ENST00000471526 FCER1AP12319 257 aa23.08■■□□□ 1.29
SHQ1-206ENST00000471526 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa23.08■■□□□ 1.29
SHQ1-206ENST00000471526 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
SHQ1-206ENST00000471526 OSBP2Q969R2 916 aa23.08■■□□□ 1.29
SHQ1-206ENST00000471526 MKNK2Q9HBH9 465 aa23.08■■□□□ 1.29
SHQ1-206ENST00000471526 SZT2Q5T011 3432 aa23.07■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 DNM1LO00429 736 aa23.07■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 SLC25A27O95847 323 aa23.07■■□□□ 1.28
SHQ1-206ENST00000471526 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
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