RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, humanhuman

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PREB-208ENST00000468045 HDAC7Q8WUI4 952 aa20.1■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 FAM89AQ96GI7 184 aa20.1■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 TMEM87BQ96K49 555 aa20.1■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
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PREB-208ENST00000468045 USP54Q70EL1 1684 aa20.1■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 TTC26A0AVF1 554 aa20.1■□□□□ 0.81
PREB-208ENST00000468045 RCCD1A6NED2 376 aa20.1■□□□□ 0.81
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PREB-208ENST00000468045 GOLGA6BA6NDN3 693 aa20.08■□□□□ 0.8
PREB-208ENST00000468045 KCNJ18B7U540 433 aa20.08■□□□□ 0.8
PREB-208ENST00000468045 TATP17735 454 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PREB-208ENST00000468045 KCNJ12Q14500 433 aa20.08■□□□□ 0.8
PREB-208ENST00000468045 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.8
PREB-208ENST00000468045 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.08■□□□□ 0.8
PREB-208ENST00000468045 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.08■□□□□ 0.8
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PREB-208ENST00000468045 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.07■□□□□ 0.8
PREB-208ENST00000468045 GNGT1P63211 74 aa20.07■□□□□ 0.8
PREB-208ENST00000468045 MAP9Q49MG5 647 aa20.07■□□□□ 0.8
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PREB-208ENST00000468045 GDAQ9Y2T3 454 aa20.07■□□□□ 0.8
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PREB-208ENST00000468045 TCP11X2Q5H9J9 407 aa20.07■□□□□ 0.8
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PREB-208ENST00000468045 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
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PREB-208ENST00000468045 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
PREB-208ENST00000468045 PDE6AP16499 860 aa20.06■□□□□ 0.8
PREB-208ENST00000468045 CYP27A1Q02318 531 aa20.06■□□□□ 0.8
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PREB-208ENST00000468045 MTRQ99707 1265 aa20.06■□□□□ 0.8
PREB-208ENST00000468045 JADE2Q9NQC1 790 aa20.06■□□□□ 0.8
PREB-208ENST00000468045 TCIRG1Q13488 830 aa20.06■□□□□ 0.8
PREB-208ENST00000468045 WDR59Q6PJI9 974 aa20.06■□□□□ 0.8
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PREB-208ENST00000468045 STK36Q9NRP7 1315 aa20.05■□□□□ 0.8
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PREB-208ENST00000468045 GRIN2DO15399 1336 aa20.05■□□□□ 0.8
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PREB-208ENST00000468045 LIFRP42702 1097 aa20.04■□□□□ 0.8
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PREB-208ENST00000468045 ARL8AQ96BM9 186 aa20.04■□□□□ 0.8
PREB-208ENST00000468045 CEP131Q9UPN4 1083 aa20.04■□□□□ 0.8
PREB-208ENST00000468045 SNAP23O00161 211 aa20.04■□□□□ 0.8
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