RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466579.1

SDCCAG3-208, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, human

TSL 1 (best)

Gene SDCCAG3, Length 496 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FEZ1	Q99689	392 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	VCPKMT	Q9H867	229 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CPA4	Q9UI42	421 aa		11.25	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579		A0A0G2JMZ2	1700 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GNRH1	P01148	92 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	HERVK_113	P62684	666 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TFAP4	Q01664	338 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TBC1D10C	Q8IV04	446 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TNS4	Q8IZW8	715 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CEP95	Q96GE4	821 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	INCENP	Q9NQS7	918 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		11.24	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZNF213	O14771	459 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	WDR46	O15213	610 aa	Known RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TTLL1	O95922	423 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TSPY3	P0CV98	308 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TSPY8	P0CW00	308 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CTGF	P29279	349 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ARHGEF6	Q15052	776 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MAP4K1	Q92918	833 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MYPN	Q86TC9	1320 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ABCB7	O75027	752 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PRMT2	P55345	433 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	HAND2	P61296	217 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PTH1R	Q03431	593 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GMCL1P1	Q8NEA9	526 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TRIM47	Q96LD4	638 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	EFCC1	Q9HA90	598 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GOPC	Q9HD26	462 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ADAMTS5	Q9UNA0	930 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	NEDD4	P46934	1319 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TSPY2	A6NKD2	308 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579		F5H6K3	240 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CNMD	O75829	334 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KLRC3	Q07444	240 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	COG2	Q14746	738 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	KIF22	Q14807	665 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PTPN22	Q9Y2R2	807 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TRIM17	Q9Y577	477 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CDC45	O75419	566 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	NDUFB10	O96000	172 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CYP21A2	P08686	494 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PSMC4	P43686	418 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	FCGRT	P55899	365 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ERVK-9	P63128	1117 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ERVK-24	P63145	666 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ANKS1A	Q92625	1134 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ABHD8	Q96I13	439 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	GMCL1	Q96IK5	515 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	TTC14	Q96N46	770 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	HOXC10	Q9NYD6	342 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PLXNB2	O15031	1838 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	NMT2	O60551	498 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ATP2B2	Q01814	1243 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579		Q3C1V9	767 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	MB21D1	Q8N884	522 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	ESR2	Q92731	530 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	BTBD7	Q9P203	1132 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	SRRD	Q9UH36	339 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SDCCAG3-208	ENST00000466579	PPP1R9A	Q9ULJ8	1098 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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