RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466097.1

SH3BP1-205, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 777 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-205ENST00000466097 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 RLFQ13129 1914 aa17.53■□□□□ 0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 MYPNQ86TC9 1320 aa17.52■□□□□ 0.4
SH3BP1-205ENST00000466097 FGAP02671 866 aa17.52■□□□□ 0.4
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SH3BP1-205ENST00000466097 TSPY8P0CW00 308 aa17.52■□□□□ 0.4
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SH3BP1-205ENST00000466097 CCDC136Q96JN2 1154 aa17.49■□□□□ 0.39
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SH3BP1-205ENST00000466097 CLIP2Q9UDT6 1046 aa17.48■□□□□ 0.39
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SH3BP1-205ENST00000466097 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP17.47■□□□□ 0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF213O14771 459 aa17.46■□□□□ 0.39
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SH3BP1-205ENST00000466097 CHMLP26374 656 aa17.46■□□□□ 0.39
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SH3BP1-205ENST00000466097 MKL1Q969V6 931 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 ZNF333Q96JL9 665 aa17.46■□□□□ 0.39
SH3BP1-205ENST00000466097 CTNNA3Q9UI47 895 aa17.46■□□□□ 0.39
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SH3BP1-205ENST00000466097 PEX10O60683 326 aa17.45■□□□□ 0.38
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SH3BP1-205ENST00000466097 KLRC3Q07444 240 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 Q3C1V9 767 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 FAM83BQ5T0W9 1011 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 AKNAD1Q5T1N1 836 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 SH3TC2Q8TF17 1288 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 STAG1Q8WVM7 1258 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 INCENPQ9NQS7 918 aa17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
SH3BP1-205ENST00000466097 STX8Q9UNK0 236 aa17.45■□□□□ 0.38
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