RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436287.1

ACTBP11-201, Transcript of actin, beta pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene ACTBP11, Length 1,126 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF697Q5TEC3 545 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa18.11■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 KBTBD13C9JR72 458 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 EVX2Q03828 476 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 SNX17Q15036 470 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 ANO1Q5XXA6 986 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 AACSQ86V21 672 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 ABRAQ8N0Z2 381 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 MB21D1Q8N884 522 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 TANGO6Q9C0B7 1094 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 MCM9Q9NXL9 1143 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC5A4Q9NY91 659 aa18.1■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 DSG3P32926 999 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 C1orf53Q5VUE5 145 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 ERC1Q8IUD2 1116 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 ITPRIPQ8IWB1 547 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 MROH8Q9H579 483 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 UNC80Q8N2C7 3258 aa18.09■□□□□ 0.49
ACTBP11-201ENST00000436287 RLBP1P12271 317 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 PDE6AP16499 860 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 TRIM60Q495X7 471 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 C9orf50Q5SZB4 431 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 CEP85Q6P2H3 762 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM179Q6ZVK1 233 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 SIAH1Q8IUQ4 282 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 BADQ92934 168 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 SEMA6BQ9H3T3 888 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa18.08■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 DNAH12Q6ZR08 3092 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 ADCYAP1R1P41586 468 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 LRRC41Q15345 812 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC44A5Q8NCS7 719 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 PDLIM7Q9NR12 457 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 TMX2Q9Y320 296 aa18.07■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 MYH1P12882 1939 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF532Q9HCE3 1301 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 TRIM43BA6NCK2 446 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 FLOT1O75955 427 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 PLS1Q14651 629 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 NCAPG2Q86XI2 1143 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 SDR42E1Q8WUS8 393 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 ATG4CQ96DT6 458 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 MAML3Q96JK9 1138 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 SWAP70Q9UH65 585 aa18.06■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 CYP2D6P10635 497 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 FCER1AP12319 257 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 FAM47AQ5JRC9 791 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 LCORLQ8N3X6 602 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 FERMT2Q96AC1 680 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 VCPKMTQ9H867 229 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 NRBP1Q9UHY1 535 aa18.05■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 SLC25A27O95847 323 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 TLE2Q04725 743 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 SPICE1Q8N0Z3 855 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 RHPN1Q8TCX5 695 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 DYNLL2Q96FJ2 89 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 PHF24Q9UPV7 400 aa18.04■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 FRMPD3Q5JV73 1810 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 TTC28Q96AY4 2481 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 GOLIM4O00461 696 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 AKR1B1P15121 316 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 ICA1Q05084 483 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 TMEM132BQ14DG7 1078 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 CLEC10AQ8IUN9 316 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 CCDC17Q96LX7 622 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 SH2D4AQ9H788 454 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 TACC3Q9Y6A5 838 aa18.03■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 WDR46O15213 610 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 RARBP10826 455 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 ITGB8P26012 769 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 ARMT1Q9H993 441 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa18.02■□□□□ 0.48
ACTBP11-201ENST00000436287 ZNF236Q9UL36 1845 aa18.02■□□□□ 0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 PRKAB2O43741 272 aa18.01■□□□□ 0.47
ACTBP11-201ENST00000436287 RNF180Q86T96 592 aa18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 204.4 ms