RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 COG2Q14746 738 aa25.26■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 C16orf86Q6ZW13 317 aa25.26■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 DYNLL2Q96FJ2 89 aa25.26■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 SH2D4AQ9H788 454 aa25.26■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.26■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 CHGBP05060 677 aa25.25■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 PTPREP23469 700 aa25.25■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 GRB14Q14449 540 aa25.25■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 NBPF3Q9H094 633 aa25.25■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa25.25■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 TMX2Q9Y320 296 aa25.25■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.25■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 PARP14Q460N5 1801 aa25.24■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 USP17L12C9JPN9 530 aa25.24■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 USP17L21D6R901 530 aa25.24■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 AKR1B1P15121 316 aa25.24■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 CDK8P49336 464 aa25.24■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 ICA1Q05084 483 aa25.24■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 CCL14Q16627 93 aa25.24■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.24■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 GPATCH3Q96I76 525 aa25.24■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 FRMPD3Q5JV73 1810 aa25.23■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 MB21D1Q8N884 522 aa25.23■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.23■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.23■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa25.23■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 GIMAP6Q6P9H5 292 aa25.22■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 SHCBP1Q8NEM2 672 aa25.22■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 C11orf49Q9H6J7 331 aa25.22■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 VCPKMTQ9H867 229 aa25.22■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 SZT2Q5T011 3432 aa25.21■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa25.21■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 A0A1W2PPC1 479 aa25.21■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa25.21■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 CTR9Q6PD62 1173 aa25.21■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 ROBO3Q96MS0 1386 aa25.2■■□□□ 1.63
LIMS1-208ENST00000428064 SMIM22K7EJ46 135 aa25.2■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 WDR46O15213 610 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 STRNO43815 780 aa25.2■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 IGHA2P01877 340 aa25.2■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 DSG3P32926 999 aa25.2■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 SBK1Q52WX2 424 aa25.2■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 WDR78Q5VTH9 848 aa25.2■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 MFSD14CQ5VZR4 134 aa25.2■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 LHX8Q68G74 356 aa25.2■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 SPATC1LQ9H0A9 340 aa25.2■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.19■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 APPBP2Q92624 585 aa25.19■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.19■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 FLRT1Q9NZU1 646 aa25.19■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa25.18■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 COL6A1P12109 1028 aa25.18■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 PFASO15067 1338 aa25.17■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.17■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 FLOT1O75955 427 aa25.17■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 MROH8Q9H579 483 aa25.17■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 GSG1L2A8MUP6 293 aa25.16■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 MSCO60682 206 aa25.16■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 EEF2P13639 858 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 ATP2B2Q01814 1243 aa25.16■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 OLFML2BQ68BL8 750 aa25.16■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 ABRAQ8N0Z2 381 aa25.16■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 SPICE1Q8N0Z3 855 aa25.16■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 NPLOC4Q8TAT6 608 aa25.16■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 OSBP2Q969R2 916 aa25.16■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa25.16■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 GNAT2P19087 354 aa25.15■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 ERCC3P19447 782 aa25.15■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 ADORA2AP29274 412 aa25.15■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 GOPCQ9HD26 462 aa25.15■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 TSHZ3Q63HK5 1081 aa25.14■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 C7orf61Q8IZ16 206 aa25.14■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 ATG4CQ96DT6 458 aa25.14■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP25.14■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
LIMS1-208ENST00000428064 LAMA3Q16787 3333 aa25.14■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 GPAA1O43292 621 aa25.13■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 BMP8BP34820 402 aa25.13■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 DPP9Q86TI2 863 aa25.13■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa25.13■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 ERC2O15083 957 aa25.12■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 SLC25A27O95847 323 aa25.12■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 CYBAP13498 195 aa25.12■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 RASA1P20936 1047 aa25.12■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 PI4K2BQ8TCG2 481 aa25.12■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 GDF15Q99988 308 aa25.12■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 SLC5A4Q9NY91 659 aa25.12■■□□□ 1.61
LIMS1-208ENST00000428064 CYP2C19P33261 490 aa25.11■■□□□ 1.61
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