RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NFIAQ12857 509 aa11.44□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NUP133Q8WUM0 1156 aa11.44□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM198AQ9UFP1 575 aa11.44□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GLTPD2A6NH11 291 aa11.43□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CDKL5O76039 1030 aa11.43□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TSPY3P0CV98 308 aa11.43□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TSPY8P0CW00 308 aa11.43□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IFNAR1P17181 557 aa11.43□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RASA1P20936 1047 aa11.43□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CDK8P49336 464 aa11.43□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NBPF9Q3BBW0 867 aa11.43□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RCSD1Q6JBY9 416 aa11.43□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SAMD7Q7Z3H4 446 aa11.43□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FANCBQ8NB91 859 aa11.43□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C8orf76Q96K31 380 aa11.43□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CSRNP1Q96S65 589 aa11.43□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLC26A6Q9BXS9 759 aa11.43□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IL17RBQ9NRM6 502 aa11.43□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MYH8P13535 1937 aa11.42□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GUCY1A2P33402 732 aa11.42□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NUBP1P53384 320 aa11.42□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RCAN1P53805 252 aa11.42□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRT85P78386 507 aa11.42□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CATIPQ7Z7H3 387 aa11.42□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NBPF11Q86T75 865 aa11.42□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FAM212AQ96EL1 285 aa11.42□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC17Q96LX7 622 aa11.42□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ALG1Q9BT22 464 aa11.42□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HACL1Q9UJ83 578 aa11.42□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.42□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa11.42□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 STK36Q9NRP7 1315 aa11.42□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIF28PB7ZC32 967 aa11.41□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MBD3O95983 291 aa11.41□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GABPAQ06546 454 aa11.41□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TROAPQ12815 778 aa11.41□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TPRNQ4KMQ1 711 aa11.41□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC82Q8N4S0 544 aa11.41□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa11.41□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM106CQ9BVX2 250 aa11.41□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa11.41□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM63CQ9P1W3 806 aa11.41□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SIPA1L1O43166 1804 aa11.41□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SCN4AP35499 1836 aa11.41□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SHTN1A0MZ66 631 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DDAH1O94760 285 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PLEKHA8P1O95397 391 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EPS15P42566 896 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FUT2Q10981 343 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRT40Q6A162 431 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IFNL1Q8IU54 200 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZFPM1Q8IX07 1006 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANKS1AQ92625 1134 aa11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP11.4□□□□□ -0.58
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CNTNAP1P78357 1384 aa11.4□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TBC1D12O60347 775 aa11.4□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CALM1P0DP23 149 aa11.4□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CALM2P0DP24 149 aa11.4□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CALM3P0DP25 149 aa11.4□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SLURP2P0DP57 97 aa11.4□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UBE2HP62256 183 aa11.4□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RASA3Q14644 834 aa11.4□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PPP2R5BQ15173 497 aa11.4□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa11.4□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DCAF15Q66K64 600 aa11.4□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GAS2L3Q86XJ1 694 aa11.4□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DGKHQ86XP1 1220 aa11.4□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NEDD1Q8NHV4 660 aa11.4□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP11.4□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 WDR90Q96KV7 1748 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PLIN4Q96Q06 1357 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FSD2A1L4K1 749 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EPHX2P34913 555 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMTC3Q6ZXV5 915 aa11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRPM4Q8TD43 1214 aa11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms