RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426965.1

HOXD-AS2-201, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 927 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FGRP09769 529 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CHMLP26374 656 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FCGRTP55899 365 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPICE1Q8N0Z3 855 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NEDD1Q8NHV4 660 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CCDC136Q96JN2 1154 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NBPF3Q9H094 633 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NYAP2Q9P242 653 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa29.69■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PLIN4Q96Q06 1357 aa29.68■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TFAP4Q01664 338 aa29.68■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LPAR1Q92633 364 aa29.68■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CEP95Q96GE4 821 aa29.68■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SRRDQ9UH36 339 aa29.68■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CENPFP49454 3210 aa29.68■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NEFLP07196 543 aa29.67■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HAND2P61296 217 aa29.67■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MTMR4Q9NYA4 1195 aa29.67■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CNMDO75829 334 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TSPY3P0CV98 308 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TSPY8P0CW00 308 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 Q3C1V9 767 aa29.66■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ORC4O43929 436 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRKCZQ05513 592 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DSCC1Q9BVC3 393 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CLIP2Q9UDT6 1046 aa29.65■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 LBX2Q6XYB7 198 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TBC1D10CQ8IV04 446 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NKX2-3Q8TAU0 364 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MKL1Q969V6 931 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PAGR1Q9BTK6 254 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TANGO6Q9C0B7 1094 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GABRQQ9UN88 632 aa29.64■■■□□ 2.34
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 WDR46O15213 610 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HOXD10P28358 340 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PRMT2P55345 433 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERVK-9P63128 1117 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ERVK-24P63145 666 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COG2Q14746 738 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GOPCQ9HD26 462 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IL17RBQ9NRM6 502 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MYPNQ86TC9 1320 aa29.63■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BTBD7Q9P203 1132 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RAD50Q92878 1312 aa29.62■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MGAMO43451 1857 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TSPY2A6NKD2 308 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 F5H6K3 240 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 TTLL1O95922 423 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 KLRC3Q07444 240 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ARMC5Q96C12 935 aa29.61■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NDUFB10O96000 172 aa29.6■■■□□ 2.33
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HOXD-AS2-201ENST00000426965 PORCNQ9H237 461 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 HOXC10Q9NYD6 342 aa29.6■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RLFQ13129 1914 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF213O14771 459 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SGSM2O43147 1006 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RAD21O60216 631 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FLOT1O75955 427 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 DSG3P32926 999 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FLT3LGP49771 235 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FAM83BQ5T0W9 1011 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RUFY2Q8WXA3 655 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 FBXO28Q9NVF7 368 aa29.59■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SH3TC2Q8TF17 1288 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 COA7Q96BR5 231 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TOMM22Q9NS69 142 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa29.58■■■□□ 2.33
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NEDD4P46934 1319 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 NOVP48745 357 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PTH1RQ03431 593 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 BMP2KLQ5H9B9 411 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MFSD6Q6ZSS7 791 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RAET1EQ8TD07 263 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ATG4CQ96DT6 458 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GJD2Q9UKL4 321 aa29.57■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 SOX10P56693 466 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ZNF333Q96JL9 665 aa29.56■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 PCP11498 1178 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 CTNNA3Q9UI47 895 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 STX8Q9UNK0 236 aa29.55■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 MAPK4P31152 587 aa29.54■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
HOXD-AS2-201ENST00000426965 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa29.54■■■□□ 2.32
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