RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425695.5

HTATSF1-202, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene HTATSF1, Length 885 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-202ENST00000425695 PAGR1Q9BTK6 254 aa29.7■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 ANAPC4Q9UJX5 808 aa29.7■■■□□ 2.35
HTATSF1-202ENST00000425695 MGAMO43451 1857 aa29.7■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 HOXD10P28358 340 aa29.69■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 TANGO6Q9C0B7 1094 aa29.69■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 TXNRD2Q9NNW7 524 aa29.69■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 RBPJLQ9UBG7 517 aa29.69■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 CLIP2Q9UDT6 1046 aa29.69■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 SRRDQ9UH36 339 aa29.69■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP29.69■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 POTEEQ6S8J3 1075 aa29.68■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 NEDD1Q8NHV4 660 aa29.68■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 IL25Q9H293 177 aa29.68■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 TOMM22Q9NS69 142 aa29.68■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP29.68■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa29.67■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP29.67■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa29.67■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 LPAR1Q92633 364 aa29.67■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 CEP95Q96GE4 821 aa29.67■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 GOPCQ9HD26 462 aa29.67■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 NYAP2Q9P242 653 aa29.67■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 MORF4L1Q9UBU8 362 aa29.67■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 MYPNQ86TC9 1320 aa29.67■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 CHMLP26374 656 aa29.66■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 Q3C1V9 767 aa29.66■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 MTMR4Q9NYA4 1195 aa29.66■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 GABRQQ9UN88 632 aa29.66■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 TSPY2A6NKD2 308 aa29.65■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 PRKCZQ05513 592 aa29.65■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 DOCK3Q8IZD9 2030 aa29.65■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 ZMYM6O95789 1325 aa29.65■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 PRMT2P55345 433 aa29.64■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 COG2Q14746 738 aa29.64■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 RAET1EQ8TD07 263 aa29.64■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP29.64■■■□□ 2.34
HTATSF1-202ENST00000425695 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 WDR46O15213 610 aaKnown RBP29.63■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 ERVK-9P63128 1117 aa29.63■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 ERVK-24P63145 666 aa29.63■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa29.63■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 RUFY2Q8WXA3 655 aa29.63■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 COA7Q96BR5 231 aa29.63■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 HOXC10Q9NYD6 342 aa29.63■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa29.63■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 MYH4Q9Y623 1939 aa29.63■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 ORC4O43929 436 aa29.62■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 CNMDO75829 334 aa29.62■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 FLOT1O75955 427 aa29.62■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 TTLL1O95922 423 aa29.62■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 SOX10P56693 466 aa29.62■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 SH3TC2Q8TF17 1288 aa29.62■■■□□ 2.33
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HTATSF1-202ENST00000425695 DSCC1Q9BVC3 393 aa29.62■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 NBPF3Q9H094 633 aa29.62■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 F5H6K3 240 aa29.61■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 ZNF213O14771 459 aa29.61■■■□□ 2.33
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HTATSF1-202ENST00000425695 FGRP09769 529 aa29.61■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 KLRC3Q07444 240 aa29.61■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 FAM83BQ5T0W9 1011 aa29.61■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 MFSD6Q6ZSS7 791 aa29.61■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 TBC1D10CQ8IV04 446 aa29.61■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP29.61■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 BTBD7Q9P203 1132 aa29.61■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 HTTP42858 3142 aa29.61■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 PLIN4Q96Q06 1357 aa29.61■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 MYCP01106 439 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 FLT3LGP49771 235 aa29.6■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 AKNAD1Q5T1N1 836 aa29.6■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 MKL1Q969V6 931 aa29.6■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 PORCNQ9H237 461 aa29.6■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 IL17RBQ9NRM6 502 aa29.6■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 FBXO28Q9NVF7 368 aa29.6■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 NDUFB10O96000 172 aa29.59■■■□□ 2.33
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HTATSF1-202ENST00000425695 NBPF11Q86T75 865 aa29.59■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 CHMP4CQ96CF2 233 aa29.59■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 RAD50Q92878 1312 aa29.58■■■□□ 2.33
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HTATSF1-202ENST00000425695 ATG4CQ96DT6 458 aa29.58■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 CTNNA3Q9UI47 895 aa29.58■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 STX8Q9UNK0 236 aa29.58■■■□□ 2.33
HTATSF1-202ENST00000425695 RLFQ13129 1914 aa29.57■■■□□ 2.32
HTATSF1-202ENST00000425695 NKX2-3Q8TAU0 364 aa29.57■■■□□ 2.32
HTATSF1-202ENST00000425695 STAG1Q8WVM7 1258 aa29.57■■■□□ 2.32
HTATSF1-202ENST00000425695 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
HTATSF1-202ENST00000425695 CCNA1P78396 465 aa29.56■■■□□ 2.32
HTATSF1-202ENST00000425695 PTH1RQ03431 593 aa29.56■■■□□ 2.32
HTATSF1-202ENST00000425695 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
HTATSF1-202ENST00000425695 WDR78Q5VTH9 848 aa29.56■■■□□ 2.32
HTATSF1-202ENST00000425695 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
HTATSF1-202ENST00000425695 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
HTATSF1-202ENST00000425695 SGSM2O43147 1006 aa29.55■■■□□ 2.32
HTATSF1-202ENST00000425695 MAPK4P31152 587 aa29.55■■■□□ 2.32
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