RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418601.1

GTPBP1-202, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 810 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-202ENST00000418601 BMP1P13497 986 aa23.63■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 RNF180Q86T96 592 aa23.63■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 SLC5A4Q9NY91 659 aa23.63■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 GBF1Q92538 1859 aa23.62■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 STRNO43815 780 aa23.62■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 PGK1P00558 417 aa23.62■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 PLCG2P16885 1265 aa23.62■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 TFF2Q03403 129 aa23.62■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 CCDC174Q6PII3 467 aa23.62■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 MICALL1Q8N3F8 863 aa23.62■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.62■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 LRP2BPQ9P2M1 347 aa23.62■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 CHD9Q3L8U1 2897 aa23.62■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 XIRP2A4UGR9 3374 aa23.61■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 DCDC2CA8MYV0 355 aa23.61■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 BAG3O95817 575 aa23.61■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 TIMP1P01033 207 aa23.61■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP23.61■■□□□ 1.373e-7■■■□□ 15.4
GTPBP1-202ENST00000418601 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.61■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 TMEM31Q5JXX7 168 aa23.61■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa23.61■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 MAML3Q96JK9 1138 aa23.61■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 EPHX3Q9H6B9 360 aa23.61■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 AKAP2Q9Y2D5 859 aa23.61■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 ERCC3P19447 782 aa23.6■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 KCNQ1P51787 676 aa23.6■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 RAB30Q15771 203 aa23.6■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 TMEM240Q5SV17 173 aa23.6■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 RASIP1Q5U651 963 aa23.6■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa23.6■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa23.6■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 COPRSQ9NQ92 184 aa23.6■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 MSRAQ9UJ68 235 aa23.6■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 TFCP2Q12800 502 aa23.59■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 AAK1Q2M2I8 961 aa23.59■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 MFSD5Q6N075 450 aa23.59■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 SHCBP1Q8NEM2 672 aa23.59■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 ACER1Q8TDN7 264 aa23.59■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 NEUROD6Q96NK8 337 aa23.59■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 TOX2Q96NM4 488 aa23.59■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 SPATC1LQ9H0A9 340 aa23.59■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 STARD7Q9NQZ5 370 aa23.59■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 TBX21Q9UL17 535 aa23.59■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 ROBO3Q96MS0 1386 aa23.59■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 LRRC37A2A6NM11 1700 aa23.59■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 GORABQ5T7V8 394 aa23.58■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 C16orf59Q7L2K0 433 aa23.58■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 SLC28A3Q9HAS3 691 aa23.58■■□□□ 1.37
GTPBP1-202ENST00000418601 MYH1P12882 1939 aa23.57■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 APBB1O00213 710 aa23.57■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 REV3LO60673 3130 aa23.56■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 CSF2RAP15509 400 aa23.56■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 MCAMP43121 646 aa23.56■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23.56■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 NCAPG2Q86XI2 1143 aa23.56■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 TANGO6Q9C0B7 1094 aa23.56■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 ACRP10323 421 aa23.55■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 PPP4CP60510 307 aa23.55■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 PLS1Q14651 629 aa23.55■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.55■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 ZNF365Q70YC5 407 aa23.55■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.55■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.55■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 NRBP1Q9UHY1 535 aa23.55■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 ACLYP53396 1101 aa23.54■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.54■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 TMEM199Q8N511 208 aa23.54■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 MROH8Q9H579 483 aa23.54■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 SMCHD1A6NHR9 2005 aa23.54■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 MYO9BQ13459 2157 aa23.53■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 ADAMTS4O75173 837 aa23.53■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 AKR1A1P14550 325 aa23.53■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 COG2Q14746 738 aa23.53■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.53■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 MROH7Q68CQ1 1323 aa23.53■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 CHD7Q9P2D1 2997 aa23.52■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 FAM86C2PA6NEL3 165 aa23.52■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.52■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.52■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa23.52■■□□□ 1.36
GTPBP1-202ENST00000418601 ERC2O15083 957 aa23.51■■□□□ 1.35
GTPBP1-202ENST00000418601 FCER1AP12319 257 aa23.51■■□□□ 1.35
GTPBP1-202ENST00000418601 PPP2R2DQ66LE6 453 aa23.51■■□□□ 1.35
GTPBP1-202ENST00000418601 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
GTPBP1-202ENST00000418601 CABP5Q9NP86 173 aa23.51■■□□□ 1.35
GTPBP1-202ENST00000418601 C11orf16Q9NQ32 467 aa23.51■■□□□ 1.35
GTPBP1-202ENST00000418601 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.51■■□□□ 1.35
GTPBP1-202ENST00000418601 MOXD2PA6NHM9 499 aa23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms