RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416636.2

CLK2P1-201, Transcript of CDC like kinase 2, pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene CLK2P1, Length 1,294 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P1-201ENST00000416636 BTBD7Q9P203 1132 aa14.96□□□□□ -0.01
CLK2P1-201ENST00000416636 MYH4Q9Y623 1939 aa14.96□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.95□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.95□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 APPBP2Q92624 585 aa14.95□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.95□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 HTATIP2Q9BUP3 242 aa14.95□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 TMX2Q9Y320 296 aa14.95□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 TTC41PQ6P2S7 1318 aa14.94□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 DNAH12Q6ZR08 3092 aa14.94□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 RGS2P41220 211 aa14.94□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 ICA1Q05084 483 aa14.94□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 COG2Q14746 738 aa14.94□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 CCL14Q16627 93 aa14.94□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 SBK1Q52WX2 424 aa14.94□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 LPAR1Q92633 364 aa14.94□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 APBA2Q99767 749 aa14.94□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 VCPKMTQ9H867 229 aa14.94□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.94□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.94□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 PTPREP23469 700 aa14.93□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 MAP2K5Q13163 448 aa14.93□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 GIMAP6Q6P9H5 292 aa14.93□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 PI4K2BQ8TCG2 481 aa14.93□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 SLC15A5A6NIM6 579 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 GPAA1O43292 621 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 EEF2P13639 858 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 DSG3P32926 999 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 WDR78Q5VTH9 848 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 SPICE1Q8N0Z3 855 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 ANKLE1Q8NAG6 615 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 CRBNQ96SW2 442 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 SH2D4AQ9H788 454 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 KANSL2Q9H9L4 492 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 ROBO3Q96MS0 1386 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 SALL3Q9BXA9 1300 aa14.92□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 M0R2C6 588 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 ERC2O15083 957 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 WDR46O15213 610 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 HOXC6P09630 235 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 RASA1P20936 1047 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 GRB14Q14449 540 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 NECAB2Q7Z6G3 386 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa14.91□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 FLOT1O75955 427 aa14.9□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 IGHA2P01877 340 aa14.9□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 GNAT2P19087 354 aa14.9□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 MX1P20591 662 aa14.9□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 MB21D1Q8N884 522 aa14.9□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 SHCBP1Q8NEM2 672 aa14.9□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 NPLOC4Q8TAT6 608 aa14.9□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 ATG4CQ96DT6 458 aa14.9□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 NR2E3Q9Y5X4 410 aa14.9□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 SMCHD1A6NHR9 2005 aa14.9□□□□□ -0.02
CLK2P1-201ENST00000416636 MINDY4BA8MYZ0 360 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK2P1-201ENST00000416636 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CLK2P1-201ENST00000416636 STRNO43815 780 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK2P1-201ENST00000416636 ERCC3P19447 782 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK2P1-201ENST00000416636 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
CLK2P1-201ENST00000416636 ATP2B2Q01814 1243 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK2P1-201ENST00000416636 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CLK2P1-201ENST00000416636 LHX8Q68G74 356 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK2P1-201ENST00000416636 CHRDL2Q6WN34 429 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK2P1-201ENST00000416636 STK11IPQ8N1F8 1099 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK2P1-201ENST00000416636 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa14.89□□□□□ -0.03
CLK2P1-201ENST00000416636 EVI5O60447 810 aa14.88□□□□□ -0.03
CLK2P1-201ENST00000416636 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.88□□□□□ -0.03
CLK2P1-201ENST00000416636 FSD1Q9BTV5 496 aa14.88□□□□□ -0.03
CLK2P1-201ENST00000416636 NBPF3Q9H094 633 aa14.88□□□□□ -0.03
CLK2P1-201ENST00000416636 PRO3102Q9H379 93 aa14.88□□□□□ -0.03
CLK2P1-201ENST00000416636 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.88□□□□□ -0.03
CLK2P1-201ENST00000416636 FBXO28Q9NVF7 368 aa14.88□□□□□ -0.03
CLK2P1-201ENST00000416636 SZT2Q5T011 3432 aa14.87□□□□□ -0.03
CLK2P1-201ENST00000416636 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa14.87□□□□□ -0.03
CLK2P1-201ENST00000416636 APPP05067 770 aa14.87□□□□□ -0.03
CLK2P1-201ENST00000416636 ADORA2AP29274 412 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms