RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 TSPY3P0CV98 308 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 TSPY8P0CW00 308 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 Q3C1V9 767 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 POTEEQ6S8J3 1075 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 NEDD1Q8NHV4 660 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 HOXC10Q9NYD6 342 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 TACC3Q9Y6A5 838 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 COG2Q14746 738 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 NEFLP07196 543 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 COA7Q96BR5 231 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 CEP95Q96GE4 821 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 PAGR1Q9BTK6 254 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 TANGO6Q9C0B7 1094 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 GOPCQ9HD26 462 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 MTMR4Q9NYA4 1195 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 GABRQQ9UN88 632 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 MYPNQ86TC9 1320 aa25.05■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 RAD21O60216 631 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 FGRP09769 529 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 PRKCZQ05513 592 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 NBPF11Q86T75 865 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 RAET1EQ8TD07 263 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 MKL1Q969V6 931 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 ZMYM6O95789 1325 aa25.04■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 CHMLP26374 656 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 HAND2P61296 217 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 ERVK-9P63128 1117 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 ERVK-24P63145 666 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 LBX2Q6XYB7 198 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 ARMC5Q96C12 935 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 TSPY2A6NKD2 308 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 F5H6K3 240 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 WDR46O15213 610 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 ORC4O43929 436 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 CNMDO75829 334 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 TTLL1O95922 423 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 FLT3LGP49771 235 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 KLRC3Q07444 240 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 DSCC1Q9BVC3 393 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF213O14771 459 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 FLOT1O75955 427 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 DSG3P32926 999 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 SKAP1Q86WV1 359 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 SH3TC2Q8TF17 1288 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 IL25Q9H293 177 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 TOMM22Q9NS69 142 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 BTBD7Q9P203 1132 aa25.01■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 SOX10P56693 466 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 MFSD6Q6ZSS7 791 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 IL17RBQ9NRM6 502 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 GJD2Q9UKL4 321 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 MAPK4P31152 587 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM83BQ5T0W9 1011 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 AKNAD1Q5T1N1 836 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 ZNF333Q96JL9 665 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 NBPF3Q9H094 633 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 PORCNQ9H237 461 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 PLIN4Q96Q06 1357 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 NDUFB10O96000 172 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 GRK4P32298 578 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 CCNA1P78396 465 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 STAG1Q8WVM7 1258 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 NMT2O60551 498 aa24.97■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 PCP11498 1178 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 RGS19P49795 217 aa24.97■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 IRF5Q13568 498 aa24.97■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 ATG4CQ96DT6 458 aa24.97■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 RAD50Q92878 1312 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 ADCY3O60266 1144 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 TBC1D10CQ8IV04 446 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 MB21D1Q8N884 522 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 FBXO28Q9NVF7 368 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 STX8Q9UNK0 236 aa24.96■■□□□ 1.59
SH3BP4-204ENST00000416021 MYCP01106 439 aaPredicted RBP24.95■■□□□ 1.58
SH3BP4-204ENST00000416021 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
SH3BP4-204ENST00000416021 SLFN13Q68D06 897 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP4-204ENST00000416021 GPR142Q7Z601 462 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP4-204ENST00000416021 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.95■■□□□ 1.58
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