RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 IDI2Q9BXS1 227 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM198AQ9UFP1 575 aa24.87■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 A0A1B0GVL5 298 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 PPP6R2O75170 966 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 SHMT1P34896 483 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 TCP10Q12799 353 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 NPY5RQ15761 445 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 LARGE2Q8N3Y3 721 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 MYO3BQ8WXR4 1341 aa24.86■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 SLURP2P0DP57 97 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 CFAP100Q494V2 611 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 RILPL1Q5EBL4 403 aa24.85■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM205CA6NFA0 338 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC192P0DO97 292 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 NDUFA8P51970 172 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 TGFB2P61812 414 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 EHD4Q9H223 541 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 CABP5Q9NP86 173 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 MTMR4Q9NYA4 1195 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 CYTH3O43739 400 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 PIM2Q9P1W9 311 aa24.84■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP24.83■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 KINO60870 393 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 RAD17O75943 681 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 TYRO3Q06418 890 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 CCDC173Q0VFZ6 552 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 JMYQ8N9B5 988 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 MTFR1LQ9H019 292 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 DNAJC18Q9H819 358 aa24.83■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
SH3BP5-204ENST00000412806 PSMD14O00487 310 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 POLD1P28340 1107 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 CLEC10AQ8IUN9 316 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 TNFRSF25Q93038 417 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 PPP1R9BQ96SB3 815 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 BRMS1Q9HCU9 246 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 KLRF2D3W0D1 207 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 NPM3O75607 178 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 CMA1P23946 247 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 NLRP5P59047 1200 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 USP17L2Q6R6M4 530 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.82■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP24.81■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 LZTS2Q9BRK4 669 aa24.81■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 CTAGE5O15320 804 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 VIL1P09327 827 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 SOGA3Q5TF21 947 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 CLIC6Q96NY7 704 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 VPS33BQ9H267 617 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 CPVLQ9H3G5 476 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 FAM196BA6NMK8 535 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 ADAMTS3O15072 1205 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 PFKFB1P16118 471 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 ATP2B1P20020 1258 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 SHC4Q6S5L8 630 aa24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 USP17L5A8MUK1 530 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 CUTAO60888 179 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 UVSSAQ2YD98 709 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 GMLQ99445 158 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 SPZ1Q9BXG8 430 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 SH3GLB2Q9NR46 395 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 PI4KBQ9UBF8 816 aa24.79■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 SASS6Q6UVJ0 657 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 CLIP2Q9UDT6 1046 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 TTLL1O95922 423 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 PDHBP11177 359 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 WWC2Q6AWC2 1192 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 TYW1BQ6NUM6 668 aa24.78■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 RESP18Q5W5W9 173 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 NIM1KQ8IY84 436 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 HPSEQ9Y251 543 aa24.77■■□□□ 1.56
SH3BP5-204ENST00000412806 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
SH3BP5-204ENST00000412806 WNT7AO00755 349 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP5-204ENST00000412806 ENTPD3O75355 529 aa24.76■■□□□ 1.55
SH3BP5-204ENST00000412806 ZNF202O95125 648 aa24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms