RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411858.1

CCZ1B-202, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 5

Gene CCZ1B, Length 571 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-202ENST00000411858 TACC3Q9Y6A5 838 aa29.53■■■□□ 2.32
CCZ1B-202ENST00000411858 FGAP02671 866 aa29.52■■■□□ 2.32
CCZ1B-202ENST00000411858 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
CCZ1B-202ENST00000411858 EN2P19622 333 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
CCZ1B-202ENST00000411858 Q3C1V9 767 aa29.52■■■□□ 2.32
CCZ1B-202ENST00000411858 GABRQQ9UN88 632 aa29.52■■■□□ 2.32
CCZ1B-202ENST00000411858 CCDC171Q6TFL3 1326 aa29.51■■■□□ 2.32
CCZ1B-202ENST00000411858 CTDSPL2Q05D32 466 aa29.51■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 VCPKMTQ9H867 229 aa29.51■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 ZNF287Q9HBT7 754 aa29.51■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 MYPNQ86TC9 1320 aa29.5■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa29.5■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 ATP2B2Q01814 1243 aa29.5■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 PRKCZQ05513 592 aa29.5■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 ANAPC4Q9UJX5 808 aa29.5■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 PDE4BQ07343 736 aa29.49■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 SPICE1Q8N0Z3 855 aa29.49■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa29.49■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 TMEM106CQ9BVX2 250 aa29.49■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP29.49■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 CNMDO75829 334 aa29.48■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 FAM47AQ5JRC9 791 aa29.48■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 LPAR1Q92633 364 aa29.48■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 SH2D4AQ9H788 454 aa29.48■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa29.48■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 NYAP2Q9P242 653 aa29.48■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 HIP1O00291 1037 aa29.47■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 PAGR1Q9BTK6 254 aa29.47■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 MYCP01106 439 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 FLT3LGP49771 235 aa29.46■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 ERVK-9P63128 1117 aa29.46■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 ERVK-24P63145 666 aa29.46■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 TFAP4Q01664 338 aa29.46■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 COG2Q14746 738 aa29.46■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 LBX2Q6XYB7 198 aa29.46■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 NEDD1Q8NHV4 660 aa29.46■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP29.46■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 CLIP2Q9UDT6 1046 aa29.46■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa29.46■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 FGRP09769 529 aa29.45■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 RAET1EQ8TD07 263 aa29.45■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 CEP95Q96GE4 821 aa29.45■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 MTMR4Q9NYA4 1195 aa29.45■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 BTBD7Q9P203 1132 aa29.45■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 GJD2Q9UKL4 321 aa29.45■■■□□ 2.31
CCZ1B-202ENST00000411858 GRK4P32298 578 aa29.44■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 MKL1Q969V6 931 aa29.44■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 COA7Q96BR5 231 aa29.44■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 TANGO6Q9C0B7 1094 aa29.44■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 IL25Q9H293 177 aa29.44■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 HOXC10Q9NYD6 342 aa29.44■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 TSPY3P0CV98 308 aa29.43■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 TSPY8P0CW00 308 aa29.43■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 MTFR1Q15390 333 aa29.43■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 PORCNQ9H237 461 aa29.43■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 ZMYM6O95789 1325 aa29.43■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 WDR46O15213 610 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 GOPCQ9HD26 462 aa29.42■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 PLIN4Q96Q06 1357 aa29.41■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 F5H6K3 240 aa29.41■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 DSG3P32926 999 aa29.41■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 HAND2P61296 217 aa29.41■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 KLRC3Q07444 240 aa29.41■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 IRF5Q13568 498 aa29.41■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 SKAP1Q86WV1 359 aa29.41■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 NBPF3Q9H094 633 aa29.41■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 RLFQ13129 1914 aa29.4■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 ORC4O43929 436 aa29.4■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 IL17RBQ9NRM6 502 aa29.4■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 PLXNB2O15031 1838 aa29.4■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 RAD21O60216 631 aa29.39■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 ADCY3O60266 1144 aa29.39■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 FLOT1O75955 427 aa29.39■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 TTLL1O95922 423 aa29.39■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 CHMLP26374 656 aa29.39■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 SHISA4Q96DD7 197 aa29.39■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 FBXO28Q9NVF7 368 aa29.39■■■□□ 2.3
CCZ1B-202ENST00000411858 TSPY2A6NKD2 308 aa29.38■■■□□ 2.29
CCZ1B-202ENST00000411858 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
CCZ1B-202ENST00000411858 NDUFB10O96000 172 aa29.38■■■□□ 2.29
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CCZ1B-202ENST00000411858 FAM83BQ5T0W9 1011 aa29.38■■■□□ 2.29
CCZ1B-202ENST00000411858 SLAIN1Q8ND83 568 aa29.38■■■□□ 2.29
CCZ1B-202ENST00000411858 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
CCZ1B-202ENST00000411858 NMT2O60551 498 aa29.37■■■□□ 2.29
CCZ1B-202ENST00000411858 ELNP15502 786 aa29.37■■■□□ 2.29
CCZ1B-202ENST00000411858 GPR142Q7Z601 462 aa29.37■■■□□ 2.29
CCZ1B-202ENST00000411858 NKX2-3Q8TAU0 364 aa29.37■■■□□ 2.29
CCZ1B-202ENST00000411858 ATG4CQ96DT6 458 aa29.37■■■□□ 2.29
CCZ1B-202ENST00000411858 DSCC1Q9BVC3 393 aa29.37■■■□□ 2.29
CCZ1B-202ENST00000411858 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa29.37■■■□□ 2.29
CCZ1B-202ENST00000411858 TBC1D10CQ8IV04 446 aa29.36■■■□□ 2.29
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