RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395787.3

APIP-201, Transcript of APAF1 interacting protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APIP, Length 1,366 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APIP-201ENST00000395787 ERVK-9P63128 1117 aa22.8■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 ERVK-24P63145 666 aa22.8■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 UBXN2AP68543 259 aa22.8■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 CCNA1P78396 465 aa22.8■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 PPARAQ07869 468 aa22.8■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 COG2Q14746 738 aa22.8■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 FAM227BQ96M60 508 aa22.8■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 VCPKMTQ9H867 229 aa22.8■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 HOXC10Q9NYD6 342 aa22.8■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.8■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 HIP1O00291 1037 aa22.79■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 MAPK4P31152 587 aa22.79■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.79■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.79■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 A0A0D9SFI3 127 aa22.78■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 PRDM1O75626 825 aa22.78■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 TSPY3P0CV98 308 aa22.78■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 TSPY8P0CW00 308 aa22.78■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 SDSP20132 328 aa22.78■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 IRF5Q13568 498 aa22.78■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.78■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.78■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 HTTP42858 3142 aa22.78■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 WDR46O15213 610 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 WDR78Q5VTH9 848 aa22.77■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
APIP-201ENST00000395787 PEX10O60683 326 aa22.76■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 FLOT1O75955 427 aa22.76■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 VPS53Q5VIR6 699 aa22.76■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.76■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 CCDC171Q6TFL3 1326 aa22.76■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 POTEFA5A3E0 1075 aa22.76■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 ALX1Q15699 326 aa22.76■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 Q3C1V9 767 aa22.76■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 LBX2Q6XYB7 198 aa22.76■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.76■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 NYAP2Q9P242 653 aa22.76■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 CLIP2Q9UDT6 1046 aa22.76■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 ELNP15502 786 aa22.75■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 TFAP4Q01664 338 aa22.75■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 CTDSPL2Q05D32 466 aa22.75■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.75■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 SOCS4Q8WXH5 440 aa22.75■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP22.75■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 FAM47AQ5JRC9 791 aa22.74■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.74■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa22.74■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 PORCNQ9H237 461 aa22.74■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 TOMM22Q9NS69 142 aa22.74■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.74■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 CENPFP49454 3210 aa22.74■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 TSPY2A6NKD2 308 aa22.73■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 TTLL1O95922 423 aa22.73■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 FGAP02671 866 aa22.73■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 CCL5P13501 91 aa22.73■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 PDE4AP27815 886 aa22.73■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 DSG3P32926 999 aa22.73■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 PLS1Q14651 629 aa22.73■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 GPR142Q7Z601 462 aa22.73■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 MB21D1Q8N884 522 aa22.73■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 NEDD1Q8NHV4 660 aa22.73■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 CEP95Q96GE4 821 aa22.73■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 RNF208Q9H0X6 261 aa22.73■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 BTBD7Q9P203 1132 aa22.73■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 ANAPC4Q9UJX5 808 aa22.73■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 PLXNB2O15031 1838 aa22.73■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 PARP14Q460N5 1801 aa22.73■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 F5H6K3 240 aa22.72■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 FOXP2O15409 715 aa22.72■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 CNMDO75829 334 aa22.72■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 EN2P19622 333 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 CYP2B6P20813 491 aa22.72■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 KLRC3Q07444 240 aa22.72■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 MTFR1Q15390 333 aa22.72■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 MTMR4Q9NYA4 1195 aa22.72■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 GJD2Q9UKL4 321 aa22.72■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 RLFQ13129 1914 aa22.72■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 INHAP05111 366 aa22.71■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 RGS2P41220 211 aa22.71■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 FAM83BQ5T0W9 1011 aa22.71■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 TTC22Q5TAA0 569 aa22.71■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.71■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
APIP-201ENST00000395787 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa22.7■■□□□ 1.22
APIP-201ENST00000395787 ZMYM6O95789 1325 aa22.7■■□□□ 1.22
APIP-201ENST00000395787 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.7■■□□□ 1.22
APIP-201ENST00000395787 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
APIP-201ENST00000395787 HMGCRP04035 888 aa22.69■■□□□ 1.22
APIP-201ENST00000395787 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
APIP-201ENST00000395787 MKL1Q969V6 931 aa22.69■■□□□ 1.22
APIP-201ENST00000395787 ATG4CQ96DT6 458 aa22.69■■□□□ 1.22
APIP-201ENST00000395787 SPATC1LQ9H0A9 340 aa22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms