RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 KCNQ2O43526 872 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 WEE1P30291 646 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 SCTRP47872 440 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 TAF7LQ5H9L4 462 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ADALQ6DHV7 355 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 BRF1Q92994 677 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 NEK1Q96PY6 1258 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 SDF4Q9BRK5 362 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 FSD1Q9BTV5 496 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ARFGAP3Q9NP61 516 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF446Q9NWS9 450 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 COL15A1P39059 1388 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 A0A087WZG4 1122 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 NEURL1BA8MQ27 555 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ERVV-1B6SEH8 477 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 PFKFB2O60825 505 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 CPA1P15085 419 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 RXRBP28702 533 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 SYT10Q6XYQ8 523 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC191Q8NCU4 936 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 OTUD5Q96G74 571 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 MYD88Q99836 296 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ACBD3Q9H3P7 528 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 YY1AP1Q9H869 796 aa8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 USP27XA6NNY8 438 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGAP6O43182 974 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 HRO43593 1189 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ERLIN1O75477 346 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 SMC2O95347 1197 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 YEATS4O95619 227 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ME1P48163 572 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 GCKRQ14397 625 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 BRD3Q15059 726 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 LEKR1Q6ZMV7 388 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 AACSQ86V21 672 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 AOPEPQ8N6M6 819 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 FSIP1Q8NA03 581 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 IQUBQ8NA54 791 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ENGASEQ8NFI3 743 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 RABGGTAQ92696 567 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 WNT2BQ93097 391 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa8.23□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC151A5D8V7 595 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 IGKV5-2P06315 115 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 P4HBP07237 508 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 CRKLP46109 303 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 NLRP12P59046 1061 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 USP4Q13107 963 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 TTLL7Q6ZT98 887 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 BRAPQ7Z569 592 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 UBXN6Q9BZV1 441 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 GBP3Q9H0R5 595 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 TK2O00142 265 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 TADA3O75528 432 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 PLA2G4AP47712 749 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 EIF5P55010 431 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 TCIRG1Q13488 830 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ZSCAN26Q16670 478 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 TMC6Q7Z403 805 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 FAM107BQ9H098 131 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 SAP130Q9H0E3 1048 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 BRMS1Q9HCU9 246 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 RTEL1Q9NZ71 1219 aa8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 NUP98P52948 1817 aa8.21□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 TAF1LQ8IZX4 1826 aa8.21□□□□□ -1.09
CTPS1-201ENST00000372616 ITPK1Q13572 414 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-201ENST00000372616 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-201ENST00000372616 NAALADL2Q58DX5 795 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-201ENST00000372616 FAM173BQ6P4H8 233 aa8.21□□□□□ -1.1
CTPS1-201ENST00000372616 NBPF11Q86T75 865 aa8.21□□□□□ -1.1
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