RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359315.6

TPGS1-201, Transcript of tubulin polyglutamylase complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TPGS1, Length 1,114 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPGS1-201ENST00000359315 CEP95Q96GE4 821 aa32.07■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa32.07■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 PLIN4Q96Q06 1357 aa32.07■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP32.06■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 TFAP4Q01664 338 aa32.06■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 TBC1D10CQ8IV04 446 aa32.06■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 NEDD1Q8NHV4 660 aa32.06■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 NKX2-3Q8TAU0 364 aa32.06■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 RBPJLQ9UBG7 517 aa32.06■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 SH2D4AQ9H788 454 aa32.05■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 MORF4L1Q9UBU8 362 aa32.05■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 TSPY3P0CV98 308 aa32.04■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 TSPY8P0CW00 308 aa32.04■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 FCGRTP55899 365 aa32.04■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 NYAP2Q9P242 653 aa32.04■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP32.03■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 CNMDO75829 334 aa32.03■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 FGRP09769 529 aa32.03■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 ARHGEF6Q15052 776 aa32.03■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 LPAR1Q92633 364 aa32.03■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 PAGR1Q9BTK6 254 aa32.03■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 DSCC1Q9BVC3 393 aa32.03■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 TANGO6Q9C0B7 1094 aa32.03■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 MTMR4Q9NYA4 1195 aa32.03■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 CLIP2Q9UDT6 1046 aa32.03■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 ORC4O43929 436 aa32.02■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 NMT2O60551 498 aa32.02■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 PRKCZQ05513 592 aa32.02■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 Q3C1V9 767 aa32.02■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 SRRDQ9UH36 339 aa32.02■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 GABRQQ9UN88 632 aa32.02■■■□□ 2.72
TPGS1-201ENST00000359315 RAD50Q92878 1312 aa32.01■■■□□ 2.72
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TPGS1-201ENST00000359315 RAD21O60216 631 aa32■■■□□ 2.71
TPGS1-201ENST00000359315 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
TPGS1-201ENST00000359315 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
TPGS1-201ENST00000359315 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP32■■■□□ 2.71
TPGS1-201ENST00000359315 IL17RBQ9NRM6 502 aa32■■■□□ 2.71
TPGS1-201ENST00000359315 TOMM22Q9NS69 142 aa32■■■□□ 2.71
TPGS1-201ENST00000359315 HTTP42858 3142 aa32■■■□□ 2.71
TPGS1-201ENST00000359315 MYPNQ86TC9 1320 aa32■■■□□ 2.71
TPGS1-201ENST00000359315 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
TPGS1-201ENST00000359315 WDR46O15213 610 aaKnown RBP31.99■■■□□ 2.71
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TPGS1-201ENST00000359315 GOPCQ9HD26 462 aa31.99■■■□□ 2.71
TPGS1-201ENST00000359315 BTBD7Q9P203 1132 aa31.99■■■□□ 2.71
TPGS1-201ENST00000359315 NEDD4P46934 1319 aa31.99■■■□□ 2.71
TPGS1-201ENST00000359315 NDUFB10O96000 172 aa31.98■■■□□ 2.71
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TPGS1-201ENST00000359315 FAM83BQ5T0W9 1011 aa31.98■■■□□ 2.71
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TPGS1-201ENST00000359315 F5H6K3 240 aa31.97■■■□□ 2.71
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TPGS1-201ENST00000359315 KLRC3Q07444 240 aa31.97■■■□□ 2.71
TPGS1-201ENST00000359315 AKNAD1Q5T1N1 836 aa31.97■■■□□ 2.71
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TPGS1-201ENST00000359315 ZNF213O14771 459 aa31.96■■■□□ 2.71
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TPGS1-201ENST00000359315 BMP2KLQ5H9B9 411 aa31.96■■■□□ 2.71
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TPGS1-201ENST00000359315 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP31.96■■■□□ 2.71
TPGS1-201ENST00000359315 RUFY2Q8WXA3 655 aa31.96■■■□□ 2.71
TPGS1-201ENST00000359315 MKL1Q969V6 931 aa31.96■■■□□ 2.71
TPGS1-201ENST00000359315 ATG4CQ96DT6 458 aa31.96■■■□□ 2.71
TPGS1-201ENST00000359315 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa31.96■■■□□ 2.71
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TPGS1-201ENST00000359315 HOXD10P28358 340 aa31.95■■■□□ 2.71
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TPGS1-201ENST00000359315 FLT3LGP49771 235 aa31.94■■■□□ 2.7
TPGS1-201ENST00000359315 PRMT2P55345 433 aa31.94■■■□□ 2.7
TPGS1-201ENST00000359315 SOX10P56693 466 aa31.94■■■□□ 2.7
TPGS1-201ENST00000359315 MFSD6Q6ZSS7 791 aa31.94■■■□□ 2.7
TPGS1-201ENST00000359315 RASGRP2Q7LDG7 609 aa31.93■■■□□ 2.7
TPGS1-201ENST00000359315 ARMC5Q96C12 935 aa31.93■■■□□ 2.7
TPGS1-201ENST00000359315 CHMP4CQ96CF2 233 aa31.93■■■□□ 2.7
TPGS1-201ENST00000359315 STX8Q9UNK0 236 aa31.93■■■□□ 2.7
TPGS1-201ENST00000359315 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa31.92■■■□□ 2.7
TPGS1-201ENST00000359315 RAET1EQ8TD07 263 aa31.92■■■□□ 2.7
TPGS1-201ENST00000359315 NOVP48745 357 aa31.91■■■□□ 2.7
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TPGS1-201ENST00000359315 COA7Q96BR5 231 aa31.91■■■□□ 2.7
TPGS1-201ENST00000359315 HOXC10Q9NYD6 342 aa31.91■■■□□ 2.7
TPGS1-201ENST00000359315 RLFQ13129 1914 aa31.9■■■□□ 2.7
TPGS1-201ENST00000359315 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP31.9■■■□□ 2.7
TPGS1-201ENST00000359315 CTNNA3Q9UI47 895 aa31.9■■■□□ 2.7
TPGS1-201ENST00000359315 GJD2Q9UKL4 321 aa31.9■■■□□ 2.7
TPGS1-201ENST00000359315 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa31.9■■■□□ 2.7
TPGS1-201ENST00000359315 TAF6LQ9Y6J9 622 aa31.9■■■□□ 2.7
TPGS1-201ENST00000359315 A0A0G2JMZ2 1700 aa31.89■■■□□ 2.7
TPGS1-201ENST00000359315 MYCP01106 439 aaPredicted RBP31.89■■■□□ 2.7
TPGS1-201ENST00000359315 PCP11498 1178 aaKnown RBP31.89■■■□□ 2.7
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