RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 KCNA6P17658 529 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 CHD1O14646 1710 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 DISP1Q96F81 1524 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 LPXNO60711 386 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
PTPRT-201ENST00000356100 SLC39A6Q13433 755 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 H0YIN7 160 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 NDUFAB1O14561 156 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 GCKRQ14397 625 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ISM2Q6H9L7 571 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 PEX26Q7Z412 305 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 DAPK3O43293 454 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ATP5JP18859 108 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RPS6KA1Q15418 735 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CSRNP1Q96S65 589 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 IL13P35225 146 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 TCIRG1Q13488 830 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 TMX1Q9H3N1 280 aa6.65□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 TMEM2Q9UHN6 1383 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ABCC4O15439 1325 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ZEB2O60315 1214 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF75DP51815 510 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RASA3Q14644 834 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 AOC3Q16853 763 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 C1orf112Q9NSG2 853 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 BPIFB4P59827 614 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ADALQ6DHV7 355 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CEP57Q86XR8 500 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 SNX29Q8TEQ0 813 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CLEC11AQ9Y240 323 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGEF37A1IGU5 675 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC160A6NGH7 325 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 EXOC3O60645 756 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 SETSIPP0DME0 302 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 NCAPD2Q15021 1401 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 GAS7O60861 476 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RNF34Q969K3 372 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 IQGAP3Q86VI3 1631 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 NOSTRINQ8IVI9 506 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 TCEANC2Q96MN5 208 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 FOSP01100 380 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 FANCCQ00597 558 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ARHGEF6Q15052 776 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 SYT10Q6XYQ8 523 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 DPH6Q7L8W6 267 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 NACA2Q9H009 215 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 PRDM10Q9NQV6 1147 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC169A6NNP5 214 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ANXA1P04083 346 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RETREG2Q8NC44 543 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 Q9H521 79 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ASIC3Q9UHC3 531 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 PLCB4Q15147 1175 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 CEP85LQ5SZL2 805 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 AKNAD1Q5T1N1 836 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 NLRP1Q9C000 1473 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 KLHL30Q0D2K2 578 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 KMT5BQ4FZB7 885 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 TACC3Q9Y6A5 838 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RHOXF2BP0C7M4 288 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 NELFBQ8WX92 580 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 EPSTI1Q96J88 318 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 IFT122Q9HBG6 1241 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 FAN1Q9Y2M0 1017 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 ZMYM6O95789 1325 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRT-201ENST00000356100 PPARAQ07869 468 aa6.63□□□□□ -1.35
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