RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000347077.8

ZNF546-201, Transcript of zinc finger protein 546, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF546, Length 7,987 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF546-201ENST00000347077 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 RCAN1P53805 252 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 SFMBT2Q5VUG0 894 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 NLRX1Q86UT6 975 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 VSIG1Q86XK7 387 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 TEX2Q8IWB9 1127 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 TBX22Q9Y458 520 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 GAP43P17677 238 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 CPLX3Q8WVH0 158 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 PPCSQ9HAB8 311 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 ATP7BP35670 1465 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 RINT1Q6NUQ1 792 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 KCTD17Q8N5Z5 321 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 SELENOSQ9BQE4 189 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 MXD3Q9BW11 206 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 GPR108Q9NPR9 543 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 NDE1Q9NXR1 346 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 SUN1O94901 812 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 DCAF15Q66K64 600 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 VPS18Q9P253 973 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 AP3B1O00203 1094 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 CHMLP26374 656 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 LONP1P36776 959 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 SATB1Q01826 763 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 KBTBD3Q8NAB2 608 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 CCDC17Q96LX7 622 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 TRIM62Q9BVG3 475 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 KIF9Q9HAQ2 790 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 PASKQ96RG2 1323 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 A0A1W2PQ27 194 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 A0A1W2PQ64 194 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 A0A1W2PQD8 194 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 CAV1Q03135 178 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 PEX26Q7Z412 305 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 LPIN2Q92539 896 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 IP6K1Q92551 441 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 SAMD9Q5K651 1589 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 ACEP12821 1306 aa6.64□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 FAM177BA6PVY3 158 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 PDE8AO60658 829 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 KMT5BQ4FZB7 885 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 RSPH3Q86UC2 560 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 CEP57Q86XR8 500 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 MTRQ99707 1265 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 KCNK9Q9NPC2 374 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 GUCA1BQ9UMX6 200 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 HYOU1Q9Y4L1 999 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 SH3TC1Q8TE82 1336 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 DDAH1O94760 285 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 PSMD2Q13200 908 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 IDI1Q13907 227 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 SERPINI1Q99574 410 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 TRPV6Q9H1D0 765 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 ATG3Q9NT62 314 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 IFNKQ9P0W0 207 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 RFX7Q2KHR2 1363 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 ATP8B3O60423 1300 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 PRPSAP1Q14558 356 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 ALS2CLQ60I27 953 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 CEP85Q6P2H3 762 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 USP26Q9BXU7 913 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 TRIM15Q9C019 465 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 LPXNO60711 386 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 TTC4O95801 387 aa6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ZNF546-201ENST00000347077 DCUN1D2Q6PH85 259 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 182 ms