RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 GNAQP50148 359 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 ATP2B2Q01814 1243 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 KRT26Q7Z3Y9 468 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa22.91■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 BRD1O95696 1058 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 PHKBQ93100 1093 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 MAD2L2Q9UI95 211 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 SSC5DA1L4H1 1573 aa22.9■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 DOCK1Q14185 1865 aa22.89■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 PPFIA3O75145 1194 aa22.89■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.89■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 FUT2Q10981 343 aa22.89■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 NBPF11Q86T75 865 aa22.89■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.89■■□□□ 1.26
CCDC71-201ENST00000321895 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 SNHG28P0DPA3 235 aa22.89■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.89■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 ZDHHC9Q9Y397 364 aa22.89■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 ADM5C9JUS6 153 aa22.88■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 PDHBP11177 359 aa22.88■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.88■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.88■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 MTMR7Q9Y216 660 aa22.88■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 ASPRV1Q53RT3 343 aa22.87■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 WASF1Q92558 559 aa22.87■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.87■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 USP17L5A8MUK1 530 aa22.86■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 USP48Q86UV5 1035 aa22.86■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.86■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.86■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 RGS22Q8NE09 1264 aa22.86■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa22.86■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 MTMR6Q9Y217 621 aa22.86■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 DEXIO95424 95 aa22.86■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 KLRF2D3W0D1 207 aa22.85■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.85■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 RASGRP2Q7LDG7 609 aa22.85■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 DCAF4Q8WV16 495 aa22.85■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 WRNIP1Q96S55 665 aa22.85■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 SH2D4AQ9H788 454 aa22.85■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 H3BQV1 296 aa22.84■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 SMARCA1P28370 1054 aa22.84■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 INPP5BP32019 993 aa22.84■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 IFFO2Q5TF58 517 aa22.84■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.84■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 KLRG1Q96E93 195 aa22.84■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 ALG1Q9BT22 464 aa22.84■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 TMX2Q9Y320 296 aa22.84■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 A0A1W2PRG0 241 aa22.84■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF543Q08ER8 600 aa22.84■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.84■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 C8orf76Q96K31 380 aa22.84■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.84■■□□□ 1.25
CCDC71-201ENST00000321895 F5H6K3 240 aa22.83■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 GOLGA8HP0CJ92 632 aa22.83■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 NF2P35240 595 aa22.83■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 KLRC3Q07444 240 aa22.83■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 SLFN13Q68D06 897 aa22.83■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 CDCA5Q96FF9 252 aa22.83■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 GMCL1Q96IK5 515 aa22.83■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 RRAGCQ9HB90 399 aa22.83■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa22.83■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 ACER1Q8TDN7 264 aa22.82■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 GOPCQ9HD26 462 aa22.82■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.82■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 USP2O75604 605 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 F13A1P00488 732 aa22.81■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 ECE1P42892 770 aa22.81■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC96Q2M329 555 aa22.81■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 DLK2Q6UY11 383 aa22.81■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.81■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP22.81■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CCDC71-201ENST00000321895 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms