RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 GNAQP50148 359 aa26.2■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 TCP10Q12799 353 aa26.2■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 RTKN2Q8IZC4 609 aa26.2■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 SERPINA10Q9UK55 444 aa26.2■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa26.2■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 CYTH3O43739 400 aa26.19■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 TOP1P11387 765 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 CMA1P23946 247 aa26.19■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 JMYQ8N9B5 988 aa26.19■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 HLA-DOAP06340 250 aa26.19■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 ATP2B1P20020 1258 aa26.19■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 CLIC6Q96NY7 704 aa26.19■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 SWAP70Q9UH65 585 aa26.19■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 PLIN4Q96Q06 1357 aa26.18■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 SHMT1P34896 483 aa26.18■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.18■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 PSMD1Q99460 953 aa26.18■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 FAM198AQ9UFP1 575 aa26.18■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 CTAGE5O15320 804 aa26.17■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 PFKFB1P16118 471 aa26.17■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 UVSSAQ2YD98 709 aa26.17■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 SHC4Q6S5L8 630 aa26.17■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 SASS6Q6UVJ0 657 aa26.17■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 MTMR4Q9NYA4 1195 aa26.17■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 NLRP5P59047 1200 aa26.17■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 USP17L2Q6R6M4 530 aa26.17■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 CLEC10AQ8IUN9 316 aa26.17■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP26.17■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 IDI2Q9BXS1 227 aa26.17■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 BRMS1Q9HCU9 246 aa26.17■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 TNFRSF25Q93038 417 aa26.16■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 PDLIM2Q96JY6 352 aa26.16■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 CPVLQ9H3G5 476 aa26.16■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa26.16■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 KLRF2D3W0D1 207 aa26.16■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 ADAMTS3O15072 1205 aa26.16■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 ANO6Q4KMQ2 910 aa26.16■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.16■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 CFAP100Q494V2 611 aa26.15■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 RAD17O75943 681 aa26.14■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF202O95125 648 aa26.14■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa26.14■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJC18Q9H819 358 aa26.14■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 MYO3BQ8WXR4 1341 aa26.14■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 COL4A5P29400 1685 aa26.14■■□□□ 1.78
VSTM4-201ENST00000298454 CUTAO60888 179 aa26.14■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 SDF4Q9BRK5 362 aa26.14■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 EHD4Q9H223 541 aa26.14■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 FAM196BA6NMK8 535 aa26.13■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 TYW1BQ6NUM6 668 aa26.13■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 FAM200AQ8TCP9 573 aa26.13■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 LZTS2Q9BRK4 669 aa26.13■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 HPSEQ9Y251 543 aa26.13■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 USP17L5A8MUK1 530 aa26.13■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 WNT7AO00755 349 aa26.13■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 GRIN1Q05586 938 aa26.13■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 RESP18Q5W5W9 173 aa26.13■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 USP25Q9UHP3 1055 aa26.13■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 WWC2Q6AWC2 1192 aa26.12■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 CLIP2Q9UDT6 1046 aa26.12■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 KIF13BQ9NQT8 1826 aa26.12■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 PSMD14O00487 310 aa26.12■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC125Q86Z20 511 aa26.12■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 SPZ1Q9BXG8 430 aa26.12■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 SH3GLB2Q9NR46 395 aa26.12■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 TRIM75PA6NK02 468 aa26.11■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 PDHBP11177 359 aa26.11■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 PTPREP23469 700 aa26.11■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 SYKP43405 635 aa26.11■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 SPECC1Q5M775 1068 aa26.11■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 DNAJC25Q9H1X3 360 aa26.11■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 PIM2Q9P1W9 311 aa26.11■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 PI4KBQ9UBF8 816 aa26.11■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 CEP131Q9UPN4 1083 aa26.11■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 A0A087WWV3 80 aa26.1■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 TTLL1O95922 423 aa26.1■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa26.1■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 MYH8P13535 1937 aa26.1■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa26.1■■□□□ 1.77
VSTM4-201ENST00000298454 TGFB2P61812 414 aa26.1■■□□□ 1.77
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