RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 ANO1Q5XXA6 986 aa14.65□□□□□ -0.06
SPC25-201ENST00000282074 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.65□□□□□ -0.06
SPC25-201ENST00000282074 FERMT2Q96AC1 680 aa14.65□□□□□ -0.06
SPC25-201ENST00000282074 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SPC25-201ENST00000282074 SERPINB13Q9UIV8 391 aa14.65□□□□□ -0.06
SPC25-201ENST00000282074 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa14.65□□□□□ -0.06
SPC25-201ENST00000282074 RLFQ13129 1914 aa14.65□□□□□ -0.06
SPC25-201ENST00000282074 SIPA1L1O43166 1804 aa14.65□□□□□ -0.06
SPC25-201ENST00000282074 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 CCER2I3L3R5 266 aa14.64□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 USP5P45974 858 aa14.64□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 COG2Q14746 738 aa14.64□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 LRRC41Q15345 812 aa14.64□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.64□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 ADGRA1Q86SQ6 560 aa14.64□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 TTC6Q86TZ1 520 aa14.64□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 EHD4Q9H223 541 aa14.64□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 EYSQ5T1H1 3165 aa14.64□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 CLTBP09497 229 aa14.63□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 RAG1P15918 1043 aa14.63□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 SHCBP1Q8NEM2 672 aa14.63□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 ACER1Q8TDN7 264 aa14.63□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 ERCC3P19447 782 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 CYP7A1P22680 504 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 FPGSQ05932 587 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 GRIN2CQ14957 1233 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 ABRAQ8N0Z2 381 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 MB21D1Q8N884 522 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 SPATC1LQ9H0A9 340 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 MROH8Q9H579 483 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 GPR108Q9NPR9 543 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 PHF24Q9UPV7 400 aa14.62□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 KIAA0355O15063 1070 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 COBLO75128 1261 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 RARBP10826 455 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 DNAJB2P25686 324 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 RNF180Q86T96 592 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 ZNF576Q9H609 170 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 NCOR1O75376 2440 aa14.61□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 GNAI2P04899 355 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 EPHB4P54760 987 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 FAM47AQ5JRC9 791 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 ARHGAP45Q92619 1136 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 TANGO6Q9C0B7 1094 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 CDH23Q9H251 3354 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 FOCADQ5VW36 1801 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 FCER1AP12319 257 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 ITGB8P26012 769 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 ZAP70P43403 619 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 PLS1Q14651 629 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 TNNI3KQ59H18 835 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 NCAPG2Q86XI2 1143 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 USP38Q8NB14 1042 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 TIFAQ96CG3 184 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 MAML3Q96JK9 1138 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 DBNDD2Q9BQY9 259 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa14.6□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 DCDC2CA8MYV0 355 aa14.59□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 IDH1O75874 414 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 CCDC174Q6PII3 467 aa14.59□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.59□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 CDCA7LQ96GN5 454 aa14.59□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 TOX2Q96NM4 488 aa14.59□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SPC25-201ENST00000282074 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.58□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa14.58□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 SHMT1P34896 483 aa14.58□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 SEPT2Q15019 361 aa14.58□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 SLC44A5Q8NCS7 719 aa14.58□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 PPM1EQ8WY54 764 aa14.58□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 ASB2Q96Q27 587 aa14.58□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 PLSCR2Q9NRY7 297 aa14.58□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 ZNF236Q9UL36 1845 aa14.58□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 MYH1P12882 1939 aa14.57□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 MYO9BQ13459 2157 aa14.57□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 A0A1W2PQY0 241 aa14.57□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 SLC25A27O95847 323 aa14.57□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 GUCY1A2P33402 732 aa14.57□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 AKNAD1Q5T1N1 836 aa14.57□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa14.57□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SPC25-201ENST00000282074 IL27Q8NEV9 243 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms