RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 SLC8A3P57103 927 aa24.7■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 CEP85LQ5SZL2 805 aa24.7■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 TLDC1Q6P9B6 456 aa24.7■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 OSBP2Q969R2 916 aa24.7■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 NARFQ9UHQ1 456 aa24.7■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 UBR3Q6ZT12 1888 aa24.7■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 MCAMP43121 646 aa24.7■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 BAG6P46379 1132 aa24.7■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 PLCB4Q15147 1175 aa24.7■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 STX10O60499 249 aa24.69■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 DPCR1Q3MIW9 517 aa24.69■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 VSTM4Q8IW00 320 aa24.69■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 AKAP11Q9UKA4 1901 aa24.69■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 LRP5O75197 1615 aa24.69■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 SNAP23O00161 211 aa24.69■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 RASSF9O75901 435 aa24.69■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 RCSD1Q6JBY9 416 aa24.69■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 HPCAL4Q9UM19 191 aa24.69■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 GCKP35557 465 aa24.68■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 PARP10Q53GL7 1025 aa24.68■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 STOX1Q6ZVD7 989 aa24.68■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa24.68■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 IKBKBO14920 756 aa24.67■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 RHOXF2BP0C7M4 288 aa24.67■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.67■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 AKT1S1Q96B36 256 aa24.67■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 RHOXF2Q9BQY4 288 aa24.67■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 GRIN2DO15399 1336 aa24.67■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 C4AP0C0L4 1744 aa24.67■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 CAPS2Q9BXY5 557 aa24.67■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa24.67■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 IRAK4Q9NWZ3 460 aa24.67■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.67■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 ATP2B2Q01814 1243 aa24.66■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 FBXW7Q969H0 707 aa24.66■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 NEK1Q96PY6 1258 aa24.66■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 TOP1P11387 765 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 CCDC50Q8IVM0 306 aa24.66■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 MAB21L3Q8N8X9 362 aa24.66■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.66■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa24.66■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 CAND2O75155 1236 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 EZRP15311 586 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 PHKA1P46020 1223 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 ANKRD1Q15327 319 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 KIAA1468Q9P260 1216 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 COL4A1P02462 1669 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 BCORQ6W2J9 1755 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 FOXP2O15409 715 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 RPS6KA3P51812 740 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 UBASH3AP57075 661 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 VCPKMTQ9H867 229 aa24.65■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 FGFR2P21802 821 aa24.64■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 KRT32Q14532 448 aa24.64■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 PAGR1Q9BTK6 254 aa24.64■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 ABCC12Q96J65 1359 aa24.64■■□□□ 1.54
PITX1-201ENST00000265340 A6NNZ2 444 aa24.64■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 ADD1P35611 737 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 TUBB8Q3ZCM7 444 aa24.64■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 CCDC102BQ68D86 513 aa24.64■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP24.64■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.64■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 CTAGE15A4D2H0 777 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 CTAGE8P0CG41 777 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 NLRP12P59046 1061 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 CCDC40Q4G0X9 1142 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 CTAGE6Q86UF2 777 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 CTAGE4Q8IX94 777 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 FSIP1Q8NA03 581 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 KIF9Q9HAQ2 790 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA6CA6NDK9 693 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA6DP0CG33 693 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 ADRA2BP18089 450 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP24.63■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 WASHC4Q2M389 1173 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 MICALCLQ6ZW33 695 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa24.63■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 MROH5Q6ZUA9 1318 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 MCM3P25205 808 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 STIM1Q13586 685 aa24.62■■□□□ 1.53
PITX1-201ENST00000265340 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms