RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nek1P51954 1203 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam198bQ3UPI1 517 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rbm42Q91V81 474 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vps16Q920Q4 839 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Magi2Q9WVQ1 1275 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cul4bA2A432 970 aaKnown RBP17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 LtbrP50284 415 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tbx2Q60707 711 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc9a1Q61165 820 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lca5Q80ST9 704 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nod2Q8K3Z0 1020 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gdf11Q9Z1W4 405 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Klrc1Q9Z202 244 aa17.03■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nsrp1Q5NCR9 542 aa17.02■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Panx2Q6IMP4 677 aa17.02■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CtifQ6PEE2 600 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Anks1bQ8BIZ1 1259 aa17.02■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hps4Q99KG7 671 aa17.02■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rai14Q9EP71 979 aaKnown RBP17.02■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Col2a1P28481 1487 aa17.02■□□□□ 0.32
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Serpina16D3Z660 418 aa17.02■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pla2g4bP0C871 782 aa17.02■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Grm4Q68EF4 912 aa17.02■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hip1rQ9JKY5 1068 aa17.02■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Btaf1E9QAE3 1848 aa17.02■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tbc1d2B1AVH7 922 aa17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zscan18E9PUD6 809 aa17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 WaslQ91YD9 501 aa17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Wdhd1P59328 1117 aa17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Eya3P97480 510 aa17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 VrtnQ3SYK4 740 aa17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Armc2Q3URY6 854 aa17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cbx6Q9DBY5 414 aa17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Itgb4A2A863 1818 aa17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Abcf1Q6P542 837 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ankk1Q8BZ25 745 aa17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pspc1Q8R326 523 aaKnown RBP17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mtmr6Q8VE11 617 aa17.01■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 A0A1L1SQF0 893 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Usp17lbE9Q9U0 468 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mboat4P0C7A3 435 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gcnt1Q09324 428 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Glg1Q61543 1175 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Clic6Q8BHB9 596 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mmtag2Q99LX5 260 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Txnrd3Q99MD6 652 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Wdr64Q9D565 1086 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Baiap2l1Q9DBJ3 514 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pitpnm2Q6ZPQ6 1335 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Surf1P09925 306 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nat10Q8K224 1024 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Slc51aQ8R000 340 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sgpp1Q9JI99 430 aa17■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 A0A0U1RNP2 1173 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm5134E9QAB5 671 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmn2r68L7N2B3 851 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Adssl1P28650 457 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sdc2P43407 202 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gja5Q01231 358 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ankrd13aQ80UP5 588 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dlg1Q811D0 905 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp646Q6NV66 1788 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Adamtsl1Q8BLI0 1745 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Il7P10168 154 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam178bQ24JP3 464 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Psg29Q3URN6 468 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Akap8Q9DBR0 687 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm5114W4VSN8 858 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Alppl2P24823 529 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gtf2f1Q3THK3 508 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gtf3c5Q8R2T8 520 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tgs1Q923W1 853 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Brms1Q99N20 246 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lonrf3Q9D4H7 753 aa16.99■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sema3fO88632 785 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kcna1P16388 495 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Krt39Q6IFX4 482 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 ParnQ8VDG3 624 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 LpxnQ99N69 386 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Myo1aO88329 1043 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ccp110Q7TSH4 1004 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kctd3Q8BFX3 815 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zdhhc14Q8BQQ1 489 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trim29Q8R2Q0 587 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Mtmr9Q9Z2D0 545 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dock2Q8C3J5 1828 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 A0A1W2P6Q8 802 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm9048A0A1W2P7H4 802 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 A0A1W2P7Z8 802 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm9046A0A1W2P855 802 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Znf568E9PYI1 671 aa16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 TfrcQ62351 763 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Arid4aF8VPQ2 1261 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Klhdc9Q3USL1 350 aa16.97■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rbm12b2Q66JV4 834 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sval3Q76I99 144 aa16.97■□□□□ 0.31
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 7.3 ms