RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000105041.9

H2-Q1-202, Transcript of Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene H2-Q1, Length 1,954 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gm28047Q3US59 414 aa13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Nsrp1Q5NCR9 542 aa13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Brip1Q5SXJ3 1174 aa13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Psen2Q61144 448 aa13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Lca5Q80ST9 704 aa13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Arhgef6Q8K4I3 771 aa13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Stk38Q91VJ4 465 aa13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Eid1Q9DCR4 169 aa13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Col4a3bpQ9EQG9 624 aa13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Homer1Q9Z2Y3 366 aa13.53□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ildr2B5TVM2 661 aa13.52□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1700113H08RikE9Q9Q5 327 aa13.52□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ppef2O35385 757 aa13.52□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Pdia4P08003 638 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 U2af2P26369 475 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Sema3eP70275 775 aa13.52□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Sap30bpQ02614 308 aa13.52□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Scfd1Q8BRF7 639 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Sec62Q8BU14 398 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Shtn1Q8K2Q9 631 aa13.52□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tjap1Q9DCD5 539 aa13.52□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Igsf9bE9PZ19 1328 aa13.52□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 NrapQ80XB4 1728 aa13.52□□□□□ -0.24
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Sema3fO88632 785 aa13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Lgr6Q3UVD5 967 aa13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Myo19Q5SV80 963 aa13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Vps37dQ810I0 261 aa13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Kdm4aQ8BW72 1064 aa13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Kiaa1524Q8BWY9 907 aa13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Pnma3Q8JZW8 466 aa13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gtf3c5Q8R2T8 520 aa13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 TnmdQ9EP64 317 aa13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Clic4Q9QYB1 253 aa13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Fam205a1D3YZF6 1314 aa13.52□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ccdc88aQ5SNZ0 1873 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Dcdc2bF7BCK0 340 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 CtshP49935 333 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Zfp51Q3U4L8 781 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 D630036H23RikQ3UQD6 204 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Oog3Q3UWY1 500 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cnot7Q60809 285 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Grm4Q68EF4 912 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Slc9c1Q6UJY2 1175 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gpatch3Q8BIY1 525 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Epha10Q8BYG9 1007 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cdan1Q8CC12 1239 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ascc2Q91WR3 749 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Trex1Q91XB0 314 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Erich6bQ9D4S6 220 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Etnk1Q9D4V0 363 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tmod2Q9JKK7 351 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Acot3Q9QYR7 432 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Sel1lQ9Z2G6 790 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 NinQ61043 2035 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ampd3O08739 766 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Becn1O88597 448 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 CebpaP53566 359 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ube2oQ6ZPJ3 1288 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Galnt17Q7TT15 598 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Dnaaf2Q8BPI1 814 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 RadxQ8C779 850 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Dpp7Q9ET22 506 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Txnrd2Q9JLT4 524 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Pitpnm2Q6ZPQ6 1335 aa13.51□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Fam184aE9PW83 1143 aa13.5□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Copb2O55029 905 aa13.5□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Eif5P59325 429 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Kctd1Q5M956 257 aa13.5□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Scaf8Q6DID3 1268 aa13.5□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Myh14Q6URW6 2000 aa13.5□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Tspoap1Q7TNF8 1846 aa13.5□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Riox2Q8CD15 465 aa13.5□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Glis2Q8VDL9 521 aa13.5□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Gpsm2Q8VDU0 679 aa13.5□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ndufb9Q9CQJ8 179 aa13.5□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Yeats4Q9CR11 227 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 GrapQ9CX99 217 aa13.5□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Stk32bQ9JJX8 414 aa13.5□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Palm3A2TJV2 734 aa13.49□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Fam89aQ14BJ1 175 aa13.49□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Rhpn1Q61085 643 aa13.49□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Stxbp2Q64324 593 aa13.49□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Lrrc15Q80X72 579 aa13.49□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Prkag3Q8BGM7 489 aa13.49□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cacna1fQ9JIS7 1985 aa13.49□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Ktn1Q61595 1327 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Mctp1E9PV86 951 aa13.49□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 MthfslL7N466 203 aa13.49□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Mx1P09922 631 aa13.49□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Irf5P56477 497 aa13.49□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Sptlc2P97363 560 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Mars2Q499X9 586 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cdca8Q8BHX3 289 aa13.49□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Inpp5bQ8K337 993 aa13.49□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Rbm10Q99KG3 930 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Cd2apQ9JLQ0 637 aa13.49□□□□□ -0.25
H2-Q1-202ENSMUST00000105041 Dhx8A2A4P0 1244 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.6 ms