RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031823.11

Herc3-201, Transcript of Hect domain and RLD 3, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Herc3, Length 3,596 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3-201ENSMUST00000031823 GrapQ9CX99 217 aa13.51□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pfkfb3A7UAK5 555 aa13.5□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ttbk2Q3UVR3 1243 aa13.5□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf653Q6YND2 615 aa13.5□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nat10Q8K224 1024 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ndufb9Q9CQJ8 179 aa13.5□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Txnrd2Q9JLT4 524 aa13.5□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mcm3P25206 812 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 D630036H23RikQ3UQD6 204 aa13.5□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Usp28Q5I043 1051 aa13.5□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc9c1Q6UJY2 1175 aa13.5□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tmx3Q8BXZ1 456 aa13.5□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 SmapQ9R0P4 181 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ktn1Q61595 1327 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 MarcksP26645 309 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sp4Q62445 782 aa13.5□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vps37dQ810I0 261 aa13.5□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ms4a5Q810P8 197 aa13.5□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rec8Q8C5S7 591 aa13.5□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cfap58B2RW38 873 aa13.49□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Api5O35841 504 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 CtshP49935 333 aa13.49□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zc3h15Q3TIV5 426 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rhpn1Q61085 643 aa13.49□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Wdr24Q8CFJ9 790 aa13.49□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ndfip2Q91ZP6 311 aa13.49□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tob2Q9JM55 345 aa13.49□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Acot9Q9R0X4 439 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Brip1Q5SXJ3 1174 aa13.49□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Prpf4bQ61136 1007 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lca5Q80ST9 704 aa13.49□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Hook1Q8BIL5 728 aa13.49□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Iqca1Q9CUL5 857 aa13.49□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rbbp6P97868 1790 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mapk4Q6P5G0 583 aa13.48□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 BC048507Q80ZS7 89 aa13.48□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Inpp5bQ8K337 993 aa13.48□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bst2Q8R2Q8 172 aa13.48□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 A0A0U1RNP2 1173 aa13.48□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Irx3P81067 507 aa13.48□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam89aQ14BJ1 175 aa13.48□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 MyrflQ3UN70 904 aa13.48□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Swap70Q6A028 585 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Slc18a1Q8R090 521 aa13.48□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 TnmdQ9EP64 317 aa13.48□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 PdcQ9QW08 244 aa13.48□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cyp4x1Q6A152 507 aa13.48□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrrc15Q80X72 579 aa13.48□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Rnf214Q8BFU3 668 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gpsm2Q8VDU0 679 aa13.48□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Cd2apQ9JLQ0 637 aa13.48□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nrxn2E9Q7X7 1710 aa13.48□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Frmpd3A0A140LIW3 1774 aa13.48□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ccng2O08918 344 aa13.47□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gna11P21278 359 aa13.47□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ubxn8Q9QZ49 277 aa13.47□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gm9992B2RWK3 458 aa13.47□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 U2af2P26369 475 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Gas2l3Q3UWW6 683 aa13.47□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Unc93aQ710D3 458 aa13.47□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Nod2Q8K3Z0 1020 aa13.47□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Vps16Q920Q4 839 aa13.47□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 4931400O07RikQ9D4M5 137 aa13.47□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mctp1E9PV86 951 aa13.47□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fgl2P12804 432 aa13.47□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 LeprP48356 1162 aa13.47□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Snap25P60879 206 aa13.47□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Lrch1P62046 709 aa13.47□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 NogP97466 232 aa13.47□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ttll12Q3UDE2 639 aa13.47□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Galnt17Q7TT15 598 aa13.47□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Yeats4Q9CR11 227 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Igsf9bE9PZ19 1328 aa13.47□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Col1a1P11087 1453 aa13.47□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Bace1P56818 501 aa13.46□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mmp20P57748 482 aa13.46□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Eif5P59325 429 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Phf20Q8BLG0 1010 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kiaa1024Q8K3V7 917 aa13.46□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Ubxn2aQ99KJ0 258 aa13.46□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sema3fO88632 785 aa13.46□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mmp14P53690 582 aa13.46□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Mars2Q499X9 586 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Zfp341Q6PGC9 846 aa13.46□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 C8aQ8K182 587 aa13.46□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 Azi2Q9QYP6 405 aa13.46□□□□□ -0.25
Herc3-201ENSMUST00000031823 1700113H08RikE9Q9Q5 327 aa13.46□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 PigsQ6PD26 555 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Dusp9Q7TNL7 452 aa13.46□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Defb15Q8R2I5 79 aa13.46□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Krt82Q99M74 516 aa13.46□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Tjap1Q9DCD5 539 aa13.46□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Pdcd6ipQ9WU78 869 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 B3galt4Q9Z0F0 371 aa13.46□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Fam205a1D3YZF6 1314 aa13.45□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Znf638Q61464 1960 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 SlkO54988 1233 aa13.45□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 L1camP11627 1260 aa13.45□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Kcna1P16388 495 aa13.45□□□□□ -0.26
Herc3-201ENSMUST00000031823 Sfi1Q3UZY0 1216 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10.7 ms