RNA–Protein interactions for RNA: YLR018C

POM34, Transcript of Subunit of the transmembrane ring of the nuclear pore complex (NPC), yeastyeast

Gene POM34, Length 900 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
POM34YLR018C YKL097CP34245 136 aa9.99□□□□□ -0.81
POM34YLR018C RRP14P36080 434 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
POM34YLR018C ALY1P36117 915 aa9.99□□□□□ -0.81
POM34YLR018C YBR062CP38239 180 aa9.99□□□□□ -0.81
POM34YLR018C GGA2P38817 585 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
POM34YLR018C YHR131CP38835 850 aa9.99□□□□□ -0.81
POM34YLR018C DUN1P39009 513 aa9.99□□□□□ -0.81
POM34YLR018C DOT6P40059 670 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
POM34YLR018C PFK26P40433 827 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
POM34YLR018C TES1P41903 349 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
POM34YLR018C REF2P42073 533 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
POM34YLR018C TDA10P42938 290 aa9.99□□□□□ -0.81
POM34YLR018C YJL107CP42947 387 aa9.99□□□□□ -0.81
POM34YLR018C SFB2P53953 876 aa9.99□□□□□ -0.81
POM34YLR018C EFM6P53970 246 aa9.99□□□□□ -0.81
POM34YLR018C RPL34AP87262 121 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
POM34YLR018C YMR209CQ03648 457 aa9.99□□□□□ -0.81
POM34YLR018C RSB1Q08417 382 aa9.99□□□□□ -0.81
POM34YLR018C YMR030W-AQ3E760 96 aa9.99□□□□□ -0.81
POM34YLR018C RGS2Q99188 309 aa9.99□□□□□ -0.81
POM34YLR018C YMR085WP0CF18 432 aa9.98□□□□□ -0.81
POM34YLR018C PPZ1P26570 692 aa9.98□□□□□ -0.81
POM34YLR018C RIM1P32445 135 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
POM34YLR018C AEP1P32493 518 aa9.98□□□□□ -0.81
POM34YLR018C LIP5P32875 414 aa9.98□□□□□ -0.81
POM34YLR018C LOS1P33418 1100 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
POM34YLR018C HOS4P40480 1083 aa9.98□□□□□ -0.81
POM34YLR018C YGL140CP53120 1219 aa9.98□□□□□ -0.81
POM34YLR018C IPI3P53877 555 aa9.98□□□□□ -0.81
POM34YLR018C PET117Q02771 107 aa9.98□□□□□ -0.81
POM34YLR018C RNY1Q02933 434 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
POM34YLR018C GSF2Q04697 403 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
POM34YLR018C YPR114WQ06107 315 aa9.98□□□□□ -0.81
POM34YLR018C SYT1Q06836 1226 aa9.98□□□□□ -0.81
POM34YLR018C DAP1Q12091 152 aa9.98□□□□□ -0.81
POM34YLR018C PER33Q12144 273 aa9.98□□□□□ -0.81
POM34YLR018C KCS1Q12494 1050 aa9.98□□□□□ -0.81
POM34YLR018C YLR149CQ99296 730 aa9.98□□□□□ -0.81
POM34YLR018C LEU1P07264 779 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
POM34YLR018C GLN4P13188 809 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
POM34YLR018C MCM5P29496 775 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
POM34YLR018C IMP3P32899 183 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
POM34YLR018C SIP4P46954 829 aa9.97□□□□□ -0.81
POM34YLR018C PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
POM34YLR018C PEX8P53248 589 aa9.97□□□□□ -0.81
POM34YLR018C BUD32P53323 261 aa9.97□□□□□ -0.81
POM34YLR018C YNR065CP53751 1116 aa9.97□□□□□ -0.81
POM34YLR018C IMP4P53941 290 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
POM34YLR018C ORC3P54790 616 aa9.97□□□□□ -0.81
POM34YLR018C TFB2Q02939 513 aa9.97□□□□□ -0.81
POM34YLR018C YDR109CQ04585 715 aa9.97□□□□□ -0.81
POM34YLR018C RPS14AP06367 137 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
POM34YLR018C AMD1P15274 810 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
POM34YLR018C PMA2P19657 947 aa9.96□□□□□ -0.82
POM34YLR018C CDC10P25342 322 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
POM34YLR018C IMG2P25642 146 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
POM34YLR018C BEM3P32873 1128 aa9.96□□□□□ -0.82
POM34YLR018C TYE7P33122 291 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
POM34YLR018C SCD5P34758 872 aa9.96□□□□□ -0.82
POM34YLR018C CTF13P35203 478 aa9.96□□□□□ -0.82
POM34YLR018C RRN3P36070 627 aa9.96□□□□□ -0.82
POM34YLR018C PHO89P38361 574 aa9.96□□□□□ -0.82
POM34YLR018C RPS14BP39516 138 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
POM34YLR018C FAR3P46671 204 aa9.96□□□□□ -0.82
POM34YLR018C PYK2P52489 506 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
POM34YLR018C VAC7P53950 1165 aa9.96□□□□□ -0.82
POM34YLR018C YDR132CQ03900 495 aa9.96□□□□□ -0.82
POM34YLR018C TAF11Q04226 346 aa9.96□□□□□ -0.82
POM34YLR018C YLR177WQ06251 628 aa9.96□□□□□ -0.82
POM34YLR018C ADY3Q07732 790 aa9.96□□□□□ -0.82
POM34YLR018C CHS5Q12114 671 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
POM34YLR018C RMD5Q12508 421 aa9.96□□□□□ -0.82
POM34YLR018C GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data9.95□□□□□ -0.82not detected
POM34YLR018C MNE1P24720 663 aa9.95□□□□□ -0.82
POM34YLR018C PUP3P25451 205 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
POM34YLR018C TOM20P35180 183 aa9.95□□□□□ -0.82
POM34YLR018C MAK5P38112 773 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
POM34YLR018C NEM1P38757 446 aa9.95□□□□□ -0.82
POM34YLR018C ACO2P39533 789 aa9.95□□□□□ -0.82
POM34YLR018C MGS1P40151 587 aa9.95□□□□□ -0.82
POM34YLR018C GYP8P43570 497 aa9.95□□□□□ -0.82
POM34YLR018C RMD8P43620 662 aa9.95□□□□□ -0.82
POM34YLR018C YJR124CP47159 448 aa9.95□□□□□ -0.82
POM34YLR018C EMC4P53073 190 aa9.95□□□□□ -0.82
POM34YLR018C COG1P53079 417 aa9.95□□□□□ -0.82
POM34YLR018C YNL143CP53908 130 aa9.95□□□□□ -0.82
POM34YLR018C MCP2Q06567 569 aa9.95□□□□□ -0.82
POM34YLR018C SPE4Q12455 300 aa9.95□□□□□ -0.82
POM34YLR018C YPR117WQ06116 2489 aa9.95□□□□□ -0.82
POM34YLR018C STE2D6VTK4 431 aa9.94□□□□□ -0.82
POM34YLR018C MSF1P08425 469 aa9.94□□□□□ -0.82
POM34YLR018C YCR099CP25657 155 aa9.94□□□□□ -0.82
POM34YLR018C MSH2P25847 964 aa9.94□□□□□ -0.82
POM34YLR018C HEM3P28789 327 aa9.94□□□□□ -0.82
POM34YLR018C PHA2P32452 334 aa9.94□□□□□ -0.82
POM34YLR018C STE13P33894 931 aa9.94□□□□□ -0.82
POM34YLR018C YHR182WP38870 785 aa9.94□□□□□ -0.82
POM34YLR018C YDR089WP38966 869 aa9.94□□□□□ -0.82
POM34YLR018C RSM7P47150 247 aa9.94□□□□□ -0.82
POM34YLR018C ARH1P48360 493 aa9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.7 ms