RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639482.1

SPIN3-222, Transcript of spindlin family member 3, human

TSL 3

Gene SPIN3, Length 3,719 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPIN3-222	ENST00000639482	KIF5C	O60282	957 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	ZMYND10	O75800	440 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	CHRND	Q07001	517 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	RGS22	Q8NE09	1264 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	TFR2	Q9UP52	801 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	RBL2	Q08999	1139 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	BARGIN	Q6ZT62	677 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	OXER1	Q8TDS5	423 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	11.43	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	11.43	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	ARMT1	Q9H993	441 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	HOOK1	Q9UJC3	728 aa	Known RBP	11.43	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	TUBE1	Q9UJT0	475 aa		11.43	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	CDKL5	O76039	1030 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	PPARD	Q03181	441 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	PTPA	Q15257	358 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	RAD9B	Q6WBX8	426 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	TMEM139	Q8IV31	216 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	NAPB	Q9H115	298 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	VPS16	Q9H269	839 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	PRDM1	O75626	825 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	TPM1	P09493	284 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	MAP3K9	P80192	1104 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	FOXR1	Q6PIV2	292 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	EPSTI1	Q96J88	318 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	BLZF1	Q9H2G9	400 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	MTMR7	Q9Y216	660 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	ENC1	O14682	589 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	CASP14	P31944	242 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	RESP18	Q5W5W9	173 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC35F6	Q8N357	371 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	PNKP	Q96T60	521 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	FUT8	Q9BYC5	575 aa		11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	11.42	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	ZMYM6	O95789	1325 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	PDE6A	P16499	860 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	IGHMBP2	P38935	993 aa	Known RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	ABCB6	Q9NP58	842 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	GUCA1B	Q9UMX6	200 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	CUTA	O60888	179 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	TDO2	P48775	406 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	SPATA5	Q8NB90	893 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	SLF1	Q9BQI6	1058 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	CSRNP2	Q9H175	543 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	ABCC12	Q96J65	1359 aa		11.41	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	STX10	O60499	249 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	TXLNA	P40222	546 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	MRPS25	P82663	173 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	EVX2	Q03828	476 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	VPS72	Q15906	364 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	NBPF3	Q9H094	633 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	MYO1C	O00159	1063 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	MBD4	O95243	580 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	LPIN2	Q92539	896 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	HPSE	Q9Y251	543 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	N4BP3	O15049	544 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	ADD2	P35612	726 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	ADGRA1	Q86SQ6	560 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	RASSF8	Q8NHQ8	419 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	MAP3K14	Q99558	947 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		11.4	□□□□□ -0.58
SPIN3-222	ENST00000639482	COL22A1	Q8NFW1	1626 aa	Predicted RBP	11.4	□□□□□ -0.59
SPIN3-222	ENST00000639482	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-222	ENST00000639482	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-222	ENST00000639482	RABGGTA	Q92696	567 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-222	ENST00000639482	KCND1	Q9NSA2	647 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-222	ENST00000639482	CTNND2	Q9UQB3	1225 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-222	ENST00000639482	AFF2	P51816	1311 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-222	ENST00000639482	NRAP	Q86VF7	1730 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-222	ENST00000639482	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-222	ENST00000639482	SLC5A1	P13866	664 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-222	ENST00000639482	ZNF174	Q15697	407 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-222	ENST00000639482	KIFC2	Q96AC6	838 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-222	ENST00000639482	MED15	Q96RN5	788 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-222	ENST00000639482	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-222	ENST00000639482	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-222	ENST00000639482	TAB2	Q9NYJ8	693 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-222	ENST00000639482	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		11.39	□□□□□ -0.59
SPIN3-222	ENST00000639482	PPP6R2	O75170	966 aa		11.39	□□□□□ -0.59

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