RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622972.3

LINC00963-215, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00963, Length 444 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-215ENST00000622972 GSTO1P78417 241 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 PPATQ06203 517 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 GADL1Q6ZQY3 521 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 PARP9Q8IXQ6 854 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 PI4K2BQ8TCG2 481 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 WNT2BQ93097 391 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 KIF1BPQ96EK5 621 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 LRCH3Q96II8 777 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 ANTXR1Q9H6X2 564 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 SNRKQ9NRH2 765 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 RAI14Q9P0K7 980 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 SALL1Q9NSC2 1324 aa7.16□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 PDHXO00330 501 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 RAB11FIP3O75154 756 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 ENTPD3O75355 529 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 LDHCP07864 332 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 ZAP70P43403 619 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 NUCB1Q02818 461 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 AAMPQ13685 434 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 TTC39AQ5SRH9 613 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 ADGRA1Q86SQ6 560 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 ZFPM1Q8IX07 1006 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 LRRCC1Q9C099 1032 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 LNPKQ9C0E8 428 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 BCL11AQ9H165 835 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 LRP2BPQ9P2M1 347 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 CPA4Q9UI42 421 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 RFX7Q2KHR2 1363 aa7.15□□□□□ -1.26
LINC00963-215ENST00000622972 LAMA4Q16363 1823 aa7.15□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 ATAD5Q96QE3 1844 aa7.15□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 HOXD10P28358 340 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 PSMC4P43686 418 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 MECOMQ03112 1051 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 CCDC158Q5M9N0 1113 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 ANKRD45Q5TZF3 282 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 ANKRD23Q86SG2 305 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 ERC1Q8IUD2 1116 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 SCYL3Q8IZE3 742 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 SPATA5Q8NB90 893 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 RAET1EQ8TD07 263 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 ZNF112Q9UJU3 913 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 ZHX2Q9Y6X8 837 aa7.14□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 MYH8P13535 1937 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 PHIPQ8WWQ0 1821 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 GAKO14976 1311 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 TRIM75PA6NK02 468 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 CXCL11O14625 94 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 GNRH1P01148 92 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 EN2P19622 333 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 CHD1LQ86WJ1 897 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 TEX11Q8IYF3 940 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 RDH13Q8NBN7 331 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 SH3TC2Q8TF17 1288 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 ARMC5Q96C12 935 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 GCC1Q96CN9 775 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 IDI2Q9BXS1 227 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 TRIM34Q9BYJ4 488 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 KDM4CQ9H3R0 1056 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 STAP2Q9UGK3 403 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 KCNH4Q9UQ05 1017 aa7.13□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 PTPRFP10586 1907 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 SOWAHBA6NEL2 793 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 FAM196BA6NMK8 535 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 BAG3O95817 575 aa7.12□□□□□ -1.27
LINC00963-215ENST00000622972 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.2 ms