RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa25.27■■□□□ 1.64
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SGMS1-210ENST00000619438 SMC3Q9UQE7 1217 aa25.27■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.27■■□□□ 1.64
SGMS1-210ENST00000619438 PRKAB2O43741 272 aa25.26■■□□□ 1.63
SGMS1-210ENST00000619438 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
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SGMS1-210ENST00000619438 DSCC1Q9BVC3 393 aa25.26■■□□□ 1.63
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SGMS1-210ENST00000619438 ZNF445P59923 1031 aa25.25■■□□□ 1.63
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SGMS1-210ENST00000619438 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
SGMS1-210ENST00000619438 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.25■■□□□ 1.63
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SGMS1-210ENST00000619438 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
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SGMS1-210ENST00000619438 USP17L5A8MUK1 530 aa25.23■■□□□ 1.63
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SGMS1-210ENST00000619438 SYT1P21579 422 aa25.22■■□□□ 1.63
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SGMS1-210ENST00000619438 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.22■■□□□ 1.63
SGMS1-210ENST00000619438 ST3GAL1Q11201 340 aa25.21■■□□□ 1.63
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SGMS1-210ENST00000619438 USP17L21D6R901 530 aa25.2■■□□□ 1.62
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SGMS1-210ENST00000619438 FKTNO75072 461 aa25.2■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 CYP21A2P08686 494 aa25.2■■□□□ 1.62
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SGMS1-210ENST00000619438 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
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SGMS1-210ENST00000619438 MYH7P12883 1935 aa25.17■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 M0R2C6 588 aa25.17■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 GH2P01242 217 aa25.17■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa25.17■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.17■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 SIPA1L1O43166 1804 aa25.17■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 F13A1P00488 732 aa25.17■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 JAG1P78504 1218 aa25.17■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 EVX2Q03828 476 aa25.17■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SGMS1-210ENST00000619438 ABCB5Q2M3G0 1257 aa25.17■■□□□ 1.62
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