RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619151.4

BRF1-221, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, human

TSL 5 BASIC

Gene BRF1, Length 1,530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRF1-221	ENST00000619151	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	32.37	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		32.37	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	TRAK2	O60296	914 aa		32.36	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		32.36	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	TROAP	Q12815	778 aa		32.36	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	32.36	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		32.36	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		32.36	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	HACL1	Q9UJ83	578 aa		32.36	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		32.35	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	POTEC	B2RU33	542 aa		32.35	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		32.35	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	MAP3K14	Q99558	947 aa		32.35	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	32.35	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		32.35	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	MYH8	P13535	1937 aa		32.34	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	CACNB3	P54284	484 aa		32.34	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		32.34	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		32.34	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		32.34	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	SCN4A	P35499	1836 aa		32.34	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	WNT10B	O00744	389 aa		32.33	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	PPFIA3	O75145	1194 aa		32.33	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	KIF5B	P33176	963 aa		32.33	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	TCP10	Q12799	353 aa		32.33	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	FERMT3	Q86UX7	667 aa		32.33	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	32.33	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	PHKB	Q93100	1093 aa		32.33	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	ALG1	Q9BT22	464 aa		32.33	■■■□□ 2.77
BRF1-221	ENST00000619151	EGFR	P00533	1210 aa		32.32	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	REST	Q13127	1097 aa		32.32	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		32.32	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		32.32	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	32.32	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		32.32	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	MYO1B	O43795	1136 aa		32.31	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	FOSB	P53539	338 aa		32.31	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	PNMA1	Q8ND90	353 aa		32.31	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		32.31	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		32.31	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	KRT85	P78386	507 aa		32.31	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	TRIM29	Q14134	588 aa		32.31	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		32.31	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	CCDC17	Q96LX7	622 aa		32.31	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	32.31	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	STX8	Q9UNK0	236 aa		32.31	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	DEXI	O95424	95 aa		32.3	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	NCL	P19338	710 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	32.3	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		32.3	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	TRPM4	Q8TD43	1214 aa		32.3	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	32.3	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	EPHX2	P34913	555 aa		32.29	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		32.29	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		32.29	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		32.29	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	32.29	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	SHMT1	P34896	483 aa		32.28	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	32.28	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		32.28	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	NBPF11	Q86T75	865 aa		32.28	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		32.28	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	32.27	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	32.27	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	GNAQ	P50148	359 aa		32.27	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		32.27	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		32.27	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	NOV	P48745	357 aa		32.26	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	GUCY1B3	Q02153	619 aa		32.26	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	CEP95	Q96GE4	821 aa		32.26	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	32.26	■■■□□ 2.76
BRF1-221	ENST00000619151	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		32.26	■■■□□ 2.75
BRF1-221	ENST00000619151	SIPA1L1	O43166	1804 aa		32.25	■■■□□ 2.75
BRF1-221	ENST00000619151	MBD3	O95983	291 aa		32.25	■■■□□ 2.75
BRF1-221	ENST00000619151	AKR1B1	P15121	316 aa		32.25	■■■□□ 2.75
BRF1-221	ENST00000619151	GRM4	Q14833	912 aa		32.25	■■■□□ 2.75
BRF1-221	ENST00000619151	ATL3	Q6DD88	541 aa		32.25	■■■□□ 2.75
BRF1-221	ENST00000619151	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		32.25	■■■□□ 2.75
BRF1-221	ENST00000619151	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	32.25	■■■□□ 2.75
BRF1-221	ENST00000619151	FAM151A	Q8WW52	585 aa		32.25	■■■□□ 2.75
BRF1-221	ENST00000619151	RRAGC	Q9HB90	399 aa		32.25	■■■□□ 2.75
BRF1-221	ENST00000619151	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	32.25	■■■□□ 2.75
BRF1-221	ENST00000619151	TCHH	Q07283	1943 aa		32.24	■■■□□ 2.75
BRF1-221	ENST00000619151	CLRN2	A0PK11	232 aa		32.24	■■■□□ 2.75
BRF1-221	ENST00000619151	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
BRF1-221	ENST00000619151	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	32.24	■■■□□ 2.75
BRF1-221	ENST00000619151	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
BRF1-221	ENST00000619151	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		32.23	■■■□□ 2.75

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