RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617055.4

UBE2C-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene UBE2C, Length 705 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2C-208ENST00000617055 USP17L22D6RA61 530 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 USP17L19D6RCP7 530 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 USP17L20D6RJB6 530 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 GH2P01242 217 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 HLA-DOAP06340 250 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 PTPREP23469 700 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 RTP1P59025 263 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 ATP2B2Q01814 1243 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 USP17L24Q0WX57 530 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 C12orf42Q96LP6 360 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 FEZ1Q99689 392 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 SNRKQ9NRH2 765 aa22.22■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 MYH1P12882 1939 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.21■■□□□ 1.15
UBE2C-208ENST00000617055 HOXC6P09630 235 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 GRB14Q14449 540 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 SHHQ15465 462 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa22.2■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 CYP2C19P33261 490 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 TTC39AQ5SRH9 613 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 TRPV1Q8NER1 839 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 SEMA6BQ9H3T3 888 aa22.19■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 USP14P54578 494 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 BTBD7Q9P203 1132 aa22.18■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 VCAM1P19320 739 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 LBX2Q6XYB7 198 aa22.17■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 IGHA2P01877 340 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 CYBAP13498 195 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 CCDC158Q5M9N0 1113 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.16■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 KBTBD13C9JR72 458 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 IGSF3O75054 1194 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 GNAI2P04899 355 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 MYLIPQ8WY64 445 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 ARHGAP45Q92619 1136 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF236Q9UL36 1845 aa22.15■■□□□ 1.14
UBE2C-208ENST00000617055 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 TRIM60Q495X7 471 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 ACER1Q8TDN7 264 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 BADQ92934 168 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 PRDM6Q9NQX0 595 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.14■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 CYP7A1P22680 504 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 RARSP54136 660 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 TNNI3KQ59H18 835 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 OLFML2BQ68BL8 750 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 DPP9Q86TI2 863 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 EHD4Q9H223 541 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 GPR108Q9NPR9 543 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.13■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 ZAP70P43403 619 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 USP5P45974 858 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 SNX17Q15036 470 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 ANO1Q5XXA6 986 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 PDLIM7Q9NR12 457 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 MUC3AQ02505 3323 aa22.12■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 SEPT4O43236 478 aa22.11■■□□□ 1.13
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UBE2C-208ENST00000617055 FOSL2P15408 326 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 ADORA2AP29274 412 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 CABP5Q9NP86 173 aa22.11■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 STRNO43815 780 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 CERS3Q8IU89 383 aa22.1■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 TRIM43BA6NCK2 446 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 TTC6Q86TZ1 520 aa22.09■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 COBLO75128 1261 aa22.08■■□□□ 1.13
UBE2C-208ENST00000617055 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
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