RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616074.4

TRAPPC3-208, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,114 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-208ENST00000616074 EVI5O60447 810 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC3-208ENST00000616074 ACER1Q8TDN7 264 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC3-208ENST00000616074 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC3-208ENST00000616074 DDX19BQ9UMR2 479 aa25.21■■□□□ 1.63
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 GOLIM4O00461 696 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP14P54578 494 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 EVX2Q03828 476 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 PDE3AQ14432 1141 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 GPR142Q7Z601 462 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 NECAB2Q7Z6G3 386 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 ANKLE1Q8NAG6 615 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 BCL11AQ9H165 835 aa25.2■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP17L15C9J2P7 530 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP17L11C9JVI0 530 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP17L18D6R9N7 530 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP17L22D6RA61 530 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP17L19D6RCP7 530 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP17L20D6RJB6 530 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 HMMRO75330 724 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 CNMDO75829 334 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 VCAM1P19320 739 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 GUCY1A2P33402 732 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 GABPAQ06546 454 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP17L24Q0WX57 530 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 USP6NLQ92738 828 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 CABP5Q9NP86 173 aa25.19■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 MORN1Q5T089 497 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 PLEKHH3Q7Z736 793 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 MCM9Q9NXL9 1143 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 MYH8P13535 1937 aa25.18■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 LCORLQ8N3X6 602 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 SDR42E1Q8WUS8 393 aa25.17■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 RGS2P41220 211 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 SEPT2Q15019 361 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCL14Q16627 93 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 OGDHLQ9ULD0 1010 aa25.16■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 RAB11FIP3O75154 756 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 APBA2Q99767 749 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 MYH7P12883 1935 aa25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 CYP2D6P10635 497 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 NBPF3Q9H094 633 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 BOLA2Q9H3K6 86 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 ARMT1Q9H993 441 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.14■■□□□ 1.62
TRAPPC3-208ENST00000616074 LAMA3Q16787 3333 aa25.14■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 FRMPD3Q5JV73 1810 aa25.14■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCNA1P78396 465 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 LBX2Q6XYB7 198 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 C11orf49Q9H6J7 331 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 BTBD7Q9P203 1132 aa25.13■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 A0A1W2PRG0 241 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 MAP2K5Q13163 448 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 WDR78Q5VTH9 848 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 C7orf61Q8IZ16 206 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 SLC44A5Q8NCS7 719 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 RLFQ13129 1914 aa25.12■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 PRKAB2O43741 272 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 ATP5JP18859 108 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 ADD2P35612 726 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 STAP2Q9UGK3 403 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 A0A0G2JMZ2 1700 aa25.11■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 MBD4O95243 580 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 DYNLL2Q96FJ2 89 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 FLRT1Q9NZU1 646 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 PFASO15067 1338 aa25.1■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 CHGBP05060 677 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 PTPREP23469 700 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 LHX8Q68G74 356 aa25.09■■□□□ 1.61
TRAPPC3-208ENST00000616074 HAUS7Q99871 368 aa25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21 ms