RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EVX2Q03828 476 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DGKHQ86XP1 1220 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CD209Q9NNX6 404 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NRBP1Q9UHY1 535 aa21.38■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRIM75PA6NK02 468 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NEMFO60524 1076 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NMT2O60551 498 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LONRF3Q496Y0 759 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KAT14Q9H8E8 782 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa21.37■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IL1R1P14778 569 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ROBO3Q96MS0 1386 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IKBKBO14920 756 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TFAP4Q01664 338 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ANKS1AQ92625 1134 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MKNK2Q9HBH9 465 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PODXL2Q9NZ53 605 aa21.36■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DIXDC1Q155Q3 683 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF287Q9HBT7 754 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UBR3Q6ZT12 1888 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATP2B1P20020 1258 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PNOCQ13519 176 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RCSD1Q6JBY9 416 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMC4Q7Z404 712 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC51AQ86UW1 340 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLF2Q8IX21 1173 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SHISA4Q96DD7 197 aa21.35■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SCG2P13521 617 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PLCG2P16885 1265 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KANK3Q6NY19 840 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OLFM4Q6UX06 510 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP21.34■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa21.34■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KRT27Q7Z3Y8 459 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.33■■□□□ 1.01
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GNAQP50148 359 aa21.33■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GRIK5Q16478 980 aa21.33■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CCDC144BQ3MJ40 725 aa21.33■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPECC1Q5M775 1068 aa21.33■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa21.33■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRIMPOLQ96LW4 560 aa21.33■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LRMPQ12912 555 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FERMT2Q96AC1 680 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYH6P13533 1939 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRIM37O94972 964 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TSPY3P0CV98 308 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TSPY8P0CW00 308 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GRIN1Q05586 938 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NCAPHQ15003 741 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PNMA1Q8ND90 353 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TBC1D16Q8TBP0 767 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TNFRSF25Q93038 417 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DYNLL2Q96FJ2 89 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IL17RBQ9NRM6 502 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IMPACTQ9P2X3 320 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa21.32■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 BTDP43251 543 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GSDMDP57764 484 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NLRP5P59047 1200 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DDR1Q08345 913 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 POSTNQ15063 836 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ISM2Q6H9L7 571 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LRRC8AQ8IWT6 810 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CSRNP2Q9H175 543 aa21.31■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYO1BO43795 1136 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CALML3P27482 149 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRAPPC10P48553 1259 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MYL5Q02045 173 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.3■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UQCRHLA0A096LP55 91 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 UQCRHP07919 91 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NPY5RQ15761 445 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SH3GLB2Q9NR46 395 aa21.3■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM205CA6NFA0 338 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMC2O95347 1197 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GRM4Q14833 912 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP21.29■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TTC38Q5R3I4 469 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.29■■□□□ 1
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms