RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601247.5

FCHO1-235, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 4

Gene FCHO1, Length 458 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-235ENST00000601247 GOLGA8BA8MQT2 603 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 TRAF5O00463 557 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 NMT2O60551 498 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 TOP1P11387 765 aaKnown RBP17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 SEPT2Q15019 361 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 DLK2Q6UY11 383 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 SCYL3Q8IZE3 742 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 C2orf69Q8N8R5 385 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 SMC1BQ8NDV3 1235 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 AS3MTQ9HBK9 375 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 MTMR4Q9NYA4 1195 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 CLIP2Q9UDT6 1046 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF112Q9UJU3 913 aa17.89■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 SSC5DA1L4H1 1573 aa17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 PHF20L1A8MW92 1017 aa17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 USP2O75604 605 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 CALM1P0DP23 149 aa17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 CALM2P0DP24 149 aa17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 CALM3P0DP25 149 aa17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 MAP3K9P80192 1104 aa17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 SGMS1Q86VZ5 419 aa17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 KLRG1Q96E93 195 aa17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 AGXT2Q9BYV1 514 aa17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 IL17RBQ9NRM6 502 aa17.88■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 USP17L5A8MUK1 530 aa17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 ZBTB43O43298 467 aa17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 CELF2O95319 508 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 INPP5BP32019 993 aa17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 FKBP1BP68106 108 aa17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 SEC23AQ15436 765 aa17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 PNMA1Q8ND90 353 aa17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 NKX2-3Q8TAU0 364 aa17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 NUP133Q8WUM0 1156 aa17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 ANKS1AQ92625 1134 aa17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 FEZ1Q99689 392 aa17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 NYAP2Q9P242 653 aa17.87■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 GOLGA8AA7E2F4 631 aa17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 RAD21O60216 631 aa17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 DDAH1O94760 285 aa17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 EEF2P13639 858 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 STK3Q13188 491 aa17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 ZNF654Q8IZM8 581 aa17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 TMEM47Q9BQJ4 181 aa17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 TBC1D2Q9BYX2 928 aa17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 FZD1Q9UP38 647 aa17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 UTRNP46939 3433 aa17.86■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 KIF3CO14782 793 aa17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 TOMM70O94826 608 aa17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 APOA5Q6Q788 366 aa17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 MICU3Q86XE3 530 aa17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 GOPCQ9HD26 462 aa17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 TPCN1Q9ULQ1 816 aa17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 MTMR7Q9Y216 660 aa17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 KIF5BP33176 963 aa17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 RCAN1P53805 252 aa17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 VGLL4Q14135 290 aa17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 MAP3K11Q16584 847 aa17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 RCSD1Q6JBY9 416 aa17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 CLEC10AQ8IUN9 316 aa17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 TMX3Q96JJ7 454 aa17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 BRPF3Q9ULD4 1205 aa17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa17.84■□□□□ 0.45
FCHO1-235ENST00000601247 UNCXA6NJT0 531 aa17.83■□□□□ 0.44
FCHO1-235ENST00000601247 UBE2Q2LH0YL09 131 aa17.83■□□□□ 0.44
FCHO1-235ENST00000601247 CPLX1O14810 134 aa17.83■□□□□ 0.44
FCHO1-235ENST00000601247 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP17.83■□□□□ 0.44
FCHO1-235ENST00000601247 GUCY1A2P33402 732 aa17.83■□□□□ 0.44
FCHO1-235ENST00000601247 EVCP57679 992 aa17.83■□□□□ 0.44
FCHO1-235ENST00000601247 JAG1P78504 1218 aa17.83■□□□□ 0.44
FCHO1-235ENST00000601247 PPP2R5BQ15173 497 aa17.83■□□□□ 0.44
FCHO1-235ENST00000601247 RTN1Q16799 776 aa17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23 ms