RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597512.1

FCHO1-221, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FCHO1, Length 2,934 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-221ENST00000597512 V9GY48 417 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.92■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 PPP6R2O75170 966 aa15.91■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 KIF5BP33176 963 aa15.91■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 JMYQ8N9B5 988 aa15.91■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 MAP3K14Q99558 947 aa15.91■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 CHRNA5P30532 468 aa15.91■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 CDK8P49336 464 aa15.91■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa15.91■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 USP17L3A6NCW0 530 aa15.91■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 USP17L4A6NCW7 530 aa15.91■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 PTPAQ15257 358 aa15.91■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 SASS6Q6UVJ0 657 aa15.91■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 USP17L1Q7RTZ2 530 aa15.91■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 PNMA1Q8ND90 353 aa15.91■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 MXD3Q9BW11 206 aa15.91■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 MRVI1Q9Y6F6 885 aa15.91■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 SNED1Q8TER0 1413 aa15.9■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 FAM43AQ8N2R8 423 aa15.9■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 DBNDD1Q9H9R9 158 aa15.9■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 VPS54Q9P1Q0 977 aa15.9■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 A0A1B0GVL5 298 aa15.9■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 RILPL1Q5EBL4 403 aa15.9■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 PHF20Q9BVI0 1012 aa15.9■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 MYH8P13535 1937 aa15.9■□□□□ 0.14
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 HHIPL2Q6UWX4 724 aa15.89■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa15.89■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 CMA1P23946 247 aa15.89■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 NDUFA8P51970 172 aa15.89■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 TEKT1Q969V4 418 aa15.89■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 KRT2P35908 639 aa15.88■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 SCNN1DP51172 638 aa15.88■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 NR5A1Q13285 461 aa15.88■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 PICALMQ13492 652 aa15.88■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 FAM200AQ8TCP9 573 aa15.88■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 SHISA4Q96DD7 197 aa15.88■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 BAG6P46379 1132 aa15.88■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 GRM4Q14833 912 aa15.88■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 NEDD1Q8NHV4 660 aa15.88■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 OXER1Q8TDS5 423 aa15.88■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 USP40Q9NVE5 1235 aa15.88■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 SCN9AQ15858 1988 aa15.88■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 ECE2O60344 883 aa15.88■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 ANO6Q4KMQ2 910 aa15.88■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 BRMS1Q9HCU9 246 aa15.88■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 STX8Q9UNK0 236 aa15.88■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 GNAQP50148 359 aa15.87■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 STRIP1Q5VSL9 837 aa15.87■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 C7orf43Q8WVR3 580 aa15.87■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 TMEM47Q9BQJ4 181 aa15.87■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 SCG2P13521 617 aa15.87■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa15.87■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 KCNQ5Q9NR82 932 aa15.87■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 CUTAO60888 179 aa15.86■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 PFKFB1P16118 471 aa15.86■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 USP25Q9UHP3 1055 aa15.86■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 CAVIN2O95810 425 aa15.86■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 CRKP46108 304 aa15.86■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa15.86■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 SDF4Q9BRK5 362 aa15.86■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 CABP5Q9NP86 173 aa15.86■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 MAD2L2Q9UI95 211 aa15.86■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 CEP131Q9UPN4 1083 aa15.86■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 C10orf71Q711Q0 1435 aa15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 HS1BP3Q53T59 392 aa15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 SUPT20HQ8NEM7 779 aa15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 MRIQ9BWK5 157 aa15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 ZNF202O95125 648 aa15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 DACT2Q5SW24 774 aa15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 STAG2Q8N3U4 1231 aa15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 ZDHHC15Q96MV8 337 aa15.85■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 GABPAQ06546 454 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 STX1AQ16623 288 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 AOC3Q16853 763 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 SHC4Q6S5L8 630 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 PLIN4Q96Q06 1357 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 KIAA2012Q0VF49 1180 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 RESP18Q5W5W9 173 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 DEFB132Q7Z7B7 95 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 KIAA0825Q8IV33 1275 aa15.84■□□□□ 0.13
FCHO1-221ENST00000597512 LZTS2Q9BRK4 669 aa15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms